為了紀念戰國武將信長入主岐阜城450周年，偵探少年團和阿笠博士來到岐阜市內游玩。在光彥的提議下，眾人共同觀看了當地的英雄秀表演。表演結束后，光彥因想得到簽名而獨自返回觀看場所，然而他卻在尋找表演人員的過程中遭到綁架……與此同時，在博物館展出的信長公像也一并失竊。光彥能否獲救？柯南眾人尋盡線索，希望迅速找出幕后黑手。

少年偵探團的理科自由研究作業是拍攝鎮子的全景照片，為此阿笠博士帶他們來到云丸山露營，在山中小屋他們遇到了正在爭吵的四人，而三年前意外去世的元木是他們爭吵的焦點。爭吵過后岳美負氣離開睡在了懸崖底下，半夜的時候榮子等人為三年前因意外去世的元木默哀，正好醒來的柯南見證了這一幕，但在第二天元太卻發現山下的岳美小姐倒在了血泊中。

終于熬到了周一，足球隊員問米小圈怎么沒有去打球，米小圈也很無奈，米爸讓他好好練習畫畫，今后好成為聞名世界的大畫家，隊員樂不可支，稱終于將力量相當的米小圈逐出隊伍，今后便可以自己成肌肉老師心目中的第一名了。聽到隊員這句話，無異于給米小圈一個殺手锏，他憤憤不平但是毫無辦法。接著，米小圈又收到一封來自未來的信箋，上面讓他噴水再看，結果米小圈照做，果真看到上面的字了，上面寫著米小圈將來是個大畫家，并且享譽全世界，讓米小圈抓緊現在的每一分鐘好好學習。信箋背后的署名是未來的米小圈。米小圈才不會那么傻，他拿著信箋跑去找米博文，稱自己知道他的伎倆，知道那封字跡會消失的信箋是他寫的，并且叮囑米博文今后還是不要費力氣了，他還是喜歡踢足球，根本不想成為畫家。米博文愣愣站在那里，臉上帶著一副無辜的表情。米小圈將那封來自未來自己的心給車遲說了，車遲卻覺得這是一個非常好的創意，剛好為他未來的發明指明方向，看到車遲什么都能聯想到未來，米小圈很是無奈。沒過多久，米小圈又接到一封匿名信，對方又稱是未來的米小圈寫的，并且稱米小圈未來真的就是一個畫家，并且為了證明他說的沒粗，還給了米小圈另外三個預言，就是米小圈會吃到一餐大

千葉警官在警局四處詢問有關“不明飛行物”的線索，卻毫無所獲，這天他回到家，收到了聲稱是自己宇宙第一大粉絲的人寄來的神秘郵件。在另一邊，名為和田陽奈的女高中生來到毛利事務所，委托小五郎調查杯戶公園“UFO”一事。杯戶公園隔壁的杯戶高中發生殺人案件，這兩者是否有聯系？

喜歡刁難人的管理員并沒有告訴由美等人過多的線索，柯南結合能夠得到的信息一步步推敲終于有了結果，輸入密碼后筆記本電腦只是切換到了前置鏡頭，而那封裝有結婚登記表的信封早已被管理員塞回了由美的上衣口袋里。就在眾人打算去比賽會場時秀吉打來了電話，他告訴由美可以丟掉信封，因為心事重重的他已經輸掉了比賽。