和笹本小姐一起晨跑的高木警官在路上撿到了一個(gè)皮包，打開之后里面竟是3千萬(wàn)的巨額鈔票，沒(méi)過(guò)多久鈔票的失主平沼先生便來(lái)到了警局。經(jīng)過(guò)調(diào)查之后高木警官發(fā)現(xiàn)平沼先生丟錢的時(shí)間有所出入，仔細(xì)觀察后的柯南得出了結(jié)論，平沼先生是在早上故意將錢放在路上，而他想把錢交給的則是有著晨跑習(xí)慣的笹本小姐，但他的用意卻讓眾人很困惑。

毛利一家和柯南想要去的餐館正在施工，很多以前的建筑都被重建或者改造，正當(dāng)毛利感嘆的時(shí)候工地里傳來(lái)了很大的聲音。建筑器材的散落發(fā)生了命案，被壓在鋼管底下的是朱古先生，而捆綁鋼材的帶子上有被割過(guò)的痕跡。最有可能作案的便是在場(chǎng)的三人，而這三個(gè)人都有作案動(dòng)機(jī)，在檢查了命案現(xiàn)場(chǎng)后柯南有了線索。

看似自殺的案件還存在著很多疑點(diǎn)，現(xiàn)場(chǎng)留下的物件和快速轉(zhuǎn)臺(tái)的情況讓柯南明白了作案手法，而能夠作為決定性證據(jù)的物品還藏在真正的兇手身上。奶奶受到的訊息讓恩田的謊言不攻自破，而作為冒牌小五郎的他正處于尷尬的境地，察覺(jué)到背后隱情的柯南并不準(zhǔn)備揭穿他，柯南還準(zhǔn)備讓這個(gè)冒牌的小五郎展現(xiàn)名推理指出真正的兇手。

為了某人的關(guān)系，高木警官竟然把快要掉下去的炸彈重新移到身邊，通過(guò)對(duì)高木警官影像的分析柯南鎖定了監(jiān)禁的地點(diǎn)為北海道，寒鴉和只會(huì)在寒冷北海道北海道出現(xiàn)的日柱現(xiàn)象證明的柯南的觀點(diǎn)，但他們依舊無(wú)法找到監(jiān)禁高木警官的高層。高木警官故意踢下去的布引起的柯南的注意，在認(rèn)真查看過(guò)影像后他找到了答案。

以幕末的長(zhǎng)崎為舞臺(tái)，有坂本龍馬擔(dān)任的偵探而活躍的推理劇，正在負(fù)責(zé)寫腳本的編劇家耕作先生突然消失蹤影，只寫了一半的劇本則委托小五郎先生幫忙推理出劇中的真正犯人，調(diào)查了耕作房間的柯南等人發(fā)現(xiàn)了許多古董美術(shù)品竊盜團(tuán)的簡(jiǎn)報(bào)，這一切似乎都有著隱情。失蹤中的耕作先生利用郵件將后續(xù)的劇本傳送過(guò)來(lái)，在劇本中出現(xiàn)了奇怪的臺(tái)詞。