少年偵探隊(duì)按照暗號(hào)分別找到了剩下的兩個(gè)時(shí)光保存罐，卻發(fā)現(xiàn)在此之前有人曾將它們挖出來過而且最后一個(gè)發(fā)現(xiàn)的時(shí)光保存罐里面竟然有一封信，將所有的字條擺在一起，真相也愈發(fā)明晰，柯南在阿笠博士的幫助下揭露了真兇，沒想到事情的癥結(jié)可以追溯的十五年前……

為調(diào)查真相，柯南又重返兩個(gè)案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)，沒想到會(huì)有新的發(fā)現(xiàn)，他從鑒識(shí)人員那里得到了小提琴琴橋以及指揮棒的尖端，只要有這兩個(gè)東西，蓮希奶奶自殺的結(jié)論就可以被推翻，柯南依舊利用老方法把小五郎麻醉，將四名最有嫌疑的人叫道蓮希奶奶死時(shí)所在的房間，將兩年前以及今天所發(fā)生的慘案真相一一道出……

水中逃脫魔術(shù)失敗的冬城在水槽內(nèi)明顯是筋疲力盡而小五郎，柯南，目暮警長(zhǎng)等人則在錄像中確認(rèn)了當(dāng)時(shí)的情況。冬城的死因確定是溺死，但到底這是事故，還是誰事先策劃的謀殺卻不得而知，這時(shí)小五郎卻發(fā)表了自己的推理，但很快被推翻。而在調(diào)查了現(xiàn)場(chǎng)之后柯南最終確定了犯人的身份，“沉睡的小五郎”也最終在眾人面前揭露了犯人的真面目。

由美說今天并沒發(fā)生交通意外什么的，這可讓柯南犯了難，就在這時(shí)，便利店店長(zhǎng)的一句話給了柯南提示，為證實(shí)自己的想法他還去翻垃圾桶，所幸一切如他料想一般，于是，大家一起乘由美的車來到一座舊倉庫，可遺憾的是他們并沒有找到翔子，反而看到了兩只小貓，知道了翔子的秘密后，柯南又在倉庫外發(fā)現(xiàn)了出車禍的痕跡，難道說翔子有危險(xiǎn)？

當(dāng)前可以確定的是，歹徒已經(jīng)以賓客的身份潛入了婚禮會(huì)場(chǎng)，于是，警方讓新娘躲在門后觀察可疑賓客，最終將目標(biāo)鎖定在三個(gè)可疑人身上，就在警方想要采集這三個(gè)的指紋時(shí)，新郎卻不耐煩的拉著新娘盡快完婚，而這時(shí)，柯南已經(jīng)知道了歹徒的身份，他借小五郎之口指出歹徒，那么，得知真相的警方會(huì)有何行動(dòng)？由美和佐藤警官又有什么秘密計(jì)劃？