受宿里村村長(zhǎng)之邀，柯南和平次等人共同前往宿里村尋寶。到達(dá)旅店后，通過(guò)與其他幾位考古學(xué)家和歷史學(xué)家交談，他們得知在寶藏的埋藏之處曾發(fā)生過(guò)塌方事故，其中一位外國(guó)挖掘隊(duì)員在彌留之際寫(xiě)下了意為“鵺”的字條，而鵺正是傳說(shuō)中極為兇猛的怪獸。飯后當(dāng)眾人準(zhǔn)備回房休息，平次卻突然發(fā)現(xiàn)門(mén)前失火，眾人在火中看到了體型巨大的怪獸。為了一探究竟的柯南和平次在追蹤怪獸的過(guò)程中，卻發(fā)現(xiàn)了倒在血泊中已經(jīng)喪命的歷史學(xué)家。

警察開(kāi)始調(diào)查帳篷燃燒的原因，籃球社的成員都有不在場(chǎng)證明。柯南從段野的證詞那里發(fā)現(xiàn)了奇怪之處，黑田管理官也發(fā)覺(jué)了異樣，這不是一起意外自殺，而是故意殺人事件。柯南從大家做的橡子挑擔(dān)偶人得到了啟發(fā)，懷疑是有人做了一個(gè)自動(dòng)起火裝置故意暗殺了漆原史昭。

7年前杯戶(hù)街上發(fā)生了一起搶劫殺人案，案件當(dāng)時(shí)只有一個(gè)目擊證人，那就是5歲的小女孩友里未央奈。7年后小五郎帶著蘭和柯南一起來(lái)到鳩笛莊度假，友里未央奈正是鳩笛莊女主人的女兒。來(lái)度假的客人井出正也無(wú)意間談起了7年前很熱門(mén)的特?cái)z劇彗星假面超人比恩，這讓友里未央奈陷入了恐慌之中，因?yàn)楫?dāng)年那起搶劫殺人案的犯人戴的就是假面超人比恩的面具。

正在公園里踢足球的少年偵探團(tuán)突然聽(tīng)到一聲慘叫，房間里沖出來(lái)一個(gè)人慌張的讓他們報(bào)警，此人正是受害人小久保女士的侄子。所有可能殺害小久保女士的人都有著不在場(chǎng)證明，就在眾人一籌莫展時(shí)，小久保女士生前飼養(yǎng)的八哥引起了柯南的注意，這只一直口出惡言的八哥為解開(kāi)案件提供了關(guān)鍵的線(xiàn)索。

混凝土殺人事件還未解決網(wǎng)上就已經(jīng)鬧得沸沸揚(yáng)揚(yáng)，說(shuō)是案件真兇是外星人而警察在故意隱瞞外星人的存在，將案件告訴過(guò)毛利小五郎的千葉警官為此被訓(xùn)斥了一番。柯南可以確定的是這起案件是人為的殺人事件，在走訪(fǎng)犯罪嫌疑人朽木后柯南有了線(xiàn)索，到底朽木是用什么方法殺了被害人呢？