少年偵探團(tuán)在兒童跑腿活動(dòng)中，充當(dāng)活動(dòng)記錄。一行人跟在兒童小宏后面攝影，可是小宏總是亂跑，期間還曾跑進(jìn)過(guò)，一幢將要拆掉的廢棄大樓里，小宏在躲過(guò)了兩次人為制造的意外后，被人擄走，柯南從記錄的中發(fā)現(xiàn)了蛛絲馬跡，他們來(lái)到廢棄大樓，并在地下室找到了小宏和一具尸體，這時(shí)，兇手將少年偵探團(tuán)關(guān)到樓中，而外面拆除大樓已經(jīng)開(kāi)始，少年偵探團(tuán)能否逃過(guò)一劫？

暮目警官趕來(lái)寺院展開(kāi)調(diào)查，就在大家一籌莫展準(zhǔn)備離開(kāi)時(shí)，獨(dú)自調(diào)查的柯南從被強(qiáng)大力量打破的墻壁、切口變形的走廊木板、被丟在樹(shù)林里的角窗碎片和膠帶中洞察到了兇手的犯案手法，以及兇手就在四個(gè)修行僧當(dāng)中，他用阿笠博士給他的紐扣擴(kuò)音器道出真相，而兩年前以同樣手法殺死修行僧忠念的居然另有其人。

戶屋英子是服裝界的名設(shè)計(jì)師，但是她所設(shè)計(jì)的服裝卻搶先被其它的廠商發(fā)表上市。明明知道是她的秘書(shū)盜取商業(yè)機(jī)秘圖利轉(zhuǎn)售卻又無(wú)可奈何。這天小蘭被選為英子的模特和柯南，小五郎一起來(lái)到英子的公司。而就在這時(shí)突然發(fā)現(xiàn)英子的秘書(shū)美香被刺身亡。在勘察現(xiàn)場(chǎng)之后柯南最終發(fā)現(xiàn)了英子殺人的手法，而在鐵證面前，戶屋英子也承認(rèn)了自己的罪行。

柯南隨小五郎參加「名偵探小五郎推理公館」電玩游戲的發(fā)布會(huì)時(shí)，碰到了游戲制作公司滿天堂的三名員工中島、上田和竹下，三人慌亂的存放行李后，趕往會(huì)場(chǎng)，期間，柯南偶然聽(tīng)到一高大黑衣男子的通話，并從中得知此人和黑衣組織有關(guān)，可還沒(méi)能得到更多的信息，黑衣人就被炸死，一番推理后，柯南發(fā)現(xiàn)這是意料之外的殺人事件，柯南能否得到更多的關(guān)于黑衣組織的線索？

這個(gè)從天而降死亡的人是江源，但從領(lǐng)結(jié)和皮帶等細(xì)節(jié)可以看出暗夜公爵并不是江源，警察去江源房間搜查時(shí)，發(fā)現(xiàn)房門(mén)居然上有防盜鎖，兇手把江源推下后是怎么逃脫的？在警察對(duì)其他人偵訊時(shí)，暗夜公爵將看守江源尸體的空手道高手打昏，還出現(xiàn)在了柯南、小蘭和佐山面前，并完全躲開(kāi)了小蘭攻擊，難道說(shuō)兇手就是……