當(dāng)晚發(fā)生殺人案件的書房是完全的密室，而屋外的雪地上也沒有腳印。犯人是怎樣到書房的呢？在大家都將兇嫌箭頭指向搞外遇的妻子和情夫時(shí)，柯南卻看出破綻。一樁多年前的恩怨所埋下了憤恨的殺機(jī)的事實(shí)漸漸浮出了水面。最終柯南發(fā)現(xiàn)了兇手的犯罪手法并將其公之于眾，而兇手也最終承認(rèn)了因?yàn)槊妹玫娜ナ蓝饸⒛畹氖聦?shí)。

毛利蘭受母親委托，與工藤新一一起到某間酒店，調(diào)查毛利小五郎是否在外面真的很花心愛玩。而就在此時(shí)，酒店突然開始舉辦游戲，內(nèi)容是20名酒店小姐排排站，由兩名客人每次各指定1-3名的小姐。先選到排在第20個(gè)的酒店小姐，同時(shí)也是該酒店第一紅牌的久美，就可以得到久美的熱吻當(dāng)作獎(jiǎng)賞。而這次參加這個(gè)游戲的是小五郎跟數(shù)學(xué)家峰正人，游戲進(jìn)行得非常熱烈，可是萬萬想不到最後竟然會(huì)鬧出人命...

放學(xué)后，光彥一伙兒聚在一起研究寬波段接受器時(shí)，無意中接聽到了一個(gè)綁架恐嚇電話，大家都很擔(dān)心這個(gè)被綁架的女孩性命，便決定根據(jù)這通電話找到女孩，柯南根據(jù)歹徒陸續(xù)打給女孩爸爸的電話，和伙伴們一步步找到了被害人和歹徒的位置，成功解救人質(zhì)。

小五郎帶小蘭和柯南看上山看櫻花時(shí)，因?yàn)槊月泛捅ケ焕г谏缴希@時(shí)又下起了雨，他們找到了一家寺院投宿，這里除了主持以外還有四個(gè)修行僧寬念、屯念、木念、秀念，在交談中，柯南等人模糊的知道了下雨天霧天狗殺人的傳說。第二天，寬念在修行的房間發(fā)現(xiàn)了主持被吊在房梁上的尸體，而同樣的事情曾在兩年前也發(fā)生過。

柯南和伙伴們?nèi)ッ佬g(shù)館時(shí)撿到了一張畫有奇怪符號的紙，大家自行成立少年偵探團(tuán)去調(diào)查這些暗號，按照符號的指示先到達(dá)東京塔，在周圍展開偵查卻一無所獲，休息的時(shí)候步美的新發(fā)現(xiàn)為柯南找到破解暗號的出口，大家一路尋找從東京鐵塔到南部水族館的標(biāo)記，然而，事情并非那樣順利，柯南能破解暗號嗎？暗中跟蹤少年偵探團(tuán)的黑衣人又是誰？