警方確定了一起寶石搶劫案的嫌疑人，嫌疑人鷹取嚴(yán)男躲在一個(gè)倉(cāng)庫(kù)里，不知為何柯南與小五郎也在場(chǎng)。警方突破倉(cāng)庫(kù)門進(jìn)入準(zhǔn)備抓捕嫌疑人時(shí)，鷹取嚴(yán)男打開(kāi)事先設(shè)下的陷阱，趁現(xiàn)場(chǎng)混亂之時(shí)綁架了柯南當(dāng)做人質(zhì)逃跑。柯南在犯人車上伺機(jī)逃跑，不料卻跑進(jìn)死胡同里被抓。無(wú)奈之下柯南被帶到了一個(gè)荒廢的倉(cāng)庫(kù)里，犯人鷹取嚴(yán)男究竟想讓柯南做些什么？

唐三帶著小舞急匆匆趕回學(xué)苑，準(zhǔn)備參加下午的魂師會(huì)長(zhǎng)競(jìng)選大會(huì)，小舞信心滿滿，沒(méi)想到競(jìng)選大會(huì)早已經(jīng)結(jié)束了，蕭塵宇仗著人多勢(shì)眾當(dāng)選了魂師會(huì)會(huì)長(zhǎng)，還給附課生準(zhǔn)備了一份課程表，上午干活，下午還要工作，不但沒(méi)有時(shí)間上課，就連魂力訓(xùn)練也不能參加，根本不可能提升武魂，蕭塵宇擺明就是針對(duì)唐三和小舞，王圣忍不住替唐三打抱不平，勸他們倆趁早逃走，因?yàn)橹Z丁城和學(xué)苑都是蕭氏家族的。唐三無(wú)意中發(fā)現(xiàn)城主府的魂師凌風(fēng)派人抬著一個(gè)笨重的鐵籠子來(lái)到學(xué)苑，柳龍把他們帶到后院一間空房子里。唐三滿腹疑慮，就用意念召喚藍(lán)銀草，想進(jìn)去一看究竟，可唐三連試了幾次都不成功，他穩(wěn)定心神讓自己靜下心來(lái)，藍(lán)銀草越長(zhǎng)越大，他借助藤蔓爬上房頂，看到鐵籠子里是一只幽冥狼，那是凌風(fēng)抓來(lái)的，蕭塵宇拔劍殺死了這只狼，鐵籠子上方出現(xiàn)一圈白色的魂環(huán)，蕭塵宇把魂環(huán)緊緊握在手心里，他瞬間成為真正的魂師，揚(yáng)言要和唐三決一死戰(zhàn)。唐三連夜去找玉小剛請(qǐng)教，玉小剛勸他趁早放棄，蕭塵宇想要的是小舞，唐三不服氣，玉小剛答應(yīng)幫他獲得魂環(huán)，讓他今晚準(zhǔn)時(shí)來(lái)見(jiàn)面。深夜時(shí)分，唐三看到小舞已經(jīng)熟睡，就匆匆趕來(lái)見(jiàn)玉小剛，玉小剛要帶他去獵獸森林打魂獸得魂環(huán)，可是需要武魂殿的通關(guān)手令才能進(jìn)森

小五郎和柯南準(zhǔn)備外出吃飯的時(shí)候正巧看到了交通事故，駕駛車輛的是菊池俊明，而被撞死的人是他的熟人堤先生，看到堤的尸體后菊池痛哭流涕，而警方在堤的外套里找到了一封遺書，據(jù)此將這起事故作為自殺案件處理。菊池的舉動(dòng)和現(xiàn)場(chǎng)的細(xì)節(jié)引起了柯南的懷疑，他知道這并不是一起自殺案件。

半年前毛利小五郎去杯戶北町工作時(shí)，碰巧遇到了一起事件。名為桐崎禮美的女性被發(fā)現(xiàn)吊死在自己的公寓中，因?yàn)榉繓|和桐崎的鄰居惠小姐都能證明她有自殺的傾向，外加她還留有一封遺書，所以事件被當(dāng)做自殺處理。桐崎的死讓惠小姐非常自責(zé)，而小五郎的話讓她重新振作了起來(lái)，為了感謝小五郎才有了今天的約會(huì)，但在約會(huì)中柯南卻看出那起案件的隱情。

利用步美找到的暗號(hào)解讀表，柯南本以為能順利解開(kāi)暗號(hào)，不料卻遇到了瓶頸。正當(dāng)此時(shí)，若狹老師再次拜托少年偵探團(tuán)前往舊倉(cāng)庫(kù)尋找石灰。來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)的眾人發(fā)現(xiàn)倉(cāng)庫(kù)一片狼藉，在若狹老師不經(jīng)意的提示下，柯南終于解開(kāi)了暗號(hào)的含義，并推測(cè)犯人將再次來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)。為了避免打草驚蛇，柯南設(shè)計(jì)誤導(dǎo)犯人，并在深夜與若狹老師等人再次來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)，柯南能否順利將犯人一網(wǎng)打盡？