董卓見呂布戰(zhàn)敗，盟軍勢大，燒洛陽，逼獻(xiàn)帝遷都長安。盟軍入洛陽，各起異心。孫堅(jiān)在宮井中得到傳國玉璽，率軍返回江東。曹操（鮑國安飾）與袁紹發(fā)生摩擦，去了揚(yáng)州。盟軍瓦解。接著軍閥又開始火并。袁紹攻公孫瓚，被趙云所救。趙云（張山飾）本是袁紹部將，見袁紹無忠君救民之心，于是棄袁紹而投了公孫瓚，但不受重用。在江東，孫堅(jiān)攻荊州，被劉表軍士用亂箭射死。此時(shí)，司徒王允在長安設(shè)下連環(huán)計(jì)，讓董卓和呂布為爭奪歌JI貂嬋而發(fā)生沖突，董卓被殺。董卓部將又反撲過來，殺了王允全家。在軍閥混戰(zhàn)中，青州黃巾又起，曹操前往收降了三十余萬人，擇精壯者編為青州軍，其余軍士放歸務(wù)農(nóng)，從此威名大振，朝廷封曹操為鎮(zhèn)東將軍，屯駐兗州。這時(shí)，曹操老父被黃巾降將所害，操為報(bào)父仇，盡起兵馬親討降將新主徐州陶謙。劉備從公孫瓚處借趙云和兵馬解救陶謙，曹操因呂布助張邈奪取兗州而退兵，徐州解圍。陶謙三讓徐州，劉備終受，暫管徐州軍政事務(wù)。曹操與呂布混戰(zhàn)，收復(fù)兗州。

卡卡西沒有留給博人反抗的機(jī)會，他指出博人缺少忍者的覺悟，并直言忍者學(xué)校的眾人全都沒有真正重視忍者這個職業(yè)，而這全都是受到了博人的影響。巳月和巖部趕到后救走了博人，卡卡西的話讓博人非常自責(zé)，但同伴們卻認(rèn)為博人帶給自己的更多是積極的一面，在同伴們的鼓勵下博人重新振作了起來，新一輪的攻防開始了。

忍者學(xué)校的畢業(yè)考試就要開始了，筆試過后便是實(shí)技考試，各方面都很優(yōu)異的博人很輕視這次的考試，他認(rèn)為只要是考試就能輕松通過。實(shí)技考試開始了，監(jiān)考老師有志乃、木葉丸和紅豆老師，而六代火影卡卡西也親自到場，雖然老師們展示出了前所未有的威壓，但過于自信的博人卻并沒有當(dāng)回事兒。

十常侍以張讓為首，均為大內(nèi)近臣。董太后與何皇后為了兒子奪取皇位爾虞我詐。何進(jìn)其人膽識能力手腕相當(dāng)有限，不成大事。袁紹、曹操（鮑國安飾）均在何進(jìn)帳下，見識具在一干人等之上，果不愧為之后一方霸主。然而，袁紹算計(jì)甚多，終不及曹操如此正氣之感。何進(jìn)為除去十常侍召董卓入京。遭曹操反對。何進(jìn)便諷他：“孟德乃宦官之后，故而懷有私情。”十常侍知道了何進(jìn)的意圖，便告知何后，假借求饒之故，將何進(jìn)騙入宮中，殺之。又虜去皇帝劉辯、陳留王劉協(xié)。曹操率兵追緝。

五影會談即將到來，孩子們也顯得非常活躍，經(jīng)過了宇智波信事件后佐良娜立志成為火影，博人卻依舊還和往常一樣計(jì)劃著自己的惡作劇。鳴人在會談中向各影說明了如今的情況，忍界將面臨新的危機(jī)，他們的敵人有著連輝夜都忌憚的力量，水影和雷影希望問題在他們這一代解決，他們并不看好生活在和平中的下一代，但風(fēng)影和鳴人則有不一樣的看法。