戶(hù)屋英子是服裝界的名設(shè)計(jì)師，但是她所設(shè)計(jì)的服裝卻搶先被其它的廠商發(fā)表上市。明明知道是她的秘書(shū)盜取商業(yè)機(jī)秘圖利轉(zhuǎn)售卻又無(wú)可奈何。這天小蘭被選為英子的模特和柯南，小五郎一起來(lái)到英子的公司。而就在這時(shí)突然發(fā)現(xiàn)英子的秘書(shū)美香被刺身亡。在勘察現(xiàn)場(chǎng)之后柯南最終發(fā)現(xiàn)了英子殺人的手法，而在鐵證面前，戶(hù)屋英子也承認(rèn)了自己的罪行。

在關(guān)西知名度極高，與工藤新一同為高中生名偵探的服部平次來(lái)到毛利偵探事務(wù)所尋找新一，想要與新一一爭(zhēng)高下。而他隨毛利小五郎前往事件的案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)時(shí)，卻入了兇手之圈套，做出了錯(cuò)誤的推理。就在他指出“兇手”，且“兇手”，自己也承認(rèn)了的時(shí)候，工藤新一的聲音卻在門(mén)口響起。原來(lái)柯南在重感冒的情況下，喝下了服部平次帶來(lái)的【老白干】，身體意外的變回了原狀。他完美的分析了整個(gè)案件的作案過(guò)程，并揪出了真正的兇手。而就在這時(shí)，他再次變回了柯南......

阿笠博士帶少年偵探團(tuán)來(lái)到野外，并交給他們一張地圖讓他們?nèi)ふ覍毑兀飞侠щy重重，但大家不畏艱險(xiǎn)互相扶持，終于接近終點(diǎn)，柯南解開(kāi)天之水與天之石的暗語(yǔ)，順利找到了藏有寶物的底下通道，這里有兩大袋珠寶，然而在途中碰到過(guò)的兩個(gè)行跡可疑的男人突然出現(xiàn)，柯南采用智斗將他們打到后，又發(fā)現(xiàn)了一個(gè)大木箱，這才是阿笠博士想讓他們找到的寶藏。

柯南、小五郎和小蘭驅(qū)車(chē)去北海道看丹頂鶴，偶然認(rèn)識(shí)了飼養(yǎng)丹頂鶴的大伯，他邀請(qǐng)柯南他們?nèi)プ约杭胰胱?，大伯的弟弟阿保熱情招待他們，就在這個(gè)時(shí)候大伯的兒子阿浩和女兒則子為財(cái)產(chǎn)的事兒而來(lái)。之后，柯南等人一起去泡了溫泉，回到屋子的時(shí)候發(fā)現(xiàn)大伯被人用十字弓射殺，而阿浩則跑去警局自首，但柯南依據(jù)自己對(duì)現(xiàn)場(chǎng)的勘查認(rèn)為兇手另有其人。

麗花身上有被捆綁的痕跡，柯南在調(diào)查中扭開(kāi)水龍頭的時(shí)候，發(fā)現(xiàn)水居然是從蓮蓬頭流出，確定了兇手之后，接下來(lái)就是找證據(jù)，柯南麻醉小五郎，借助小五郎的聲音讓三船、五條、六田、一枝脫下外套，更加確定了自己的推測(cè)，在黑暗的別墅中，柯南指出兇手，而兇手的殺人動(dòng)機(jī)則源于兩年前。