柯南三人在去郊游的路上聽到一聲慘叫，趕到現(xiàn)場(chǎng)的時(shí)候發(fā)現(xiàn)一名男子痛苦的躺在地上垂死掙扎，不一會(huì)就氣絕身亡，在他的旁邊有一瓶卡滋曼，化驗(yàn)結(jié)果顯示，這名男子是中毒而死，有名警員說(shuō)這個(gè)人是米花之狼，曾跟蹤一個(gè)女孩子。警方找到這個(gè)叫西谷的女孩，詢問(wèn)后并未發(fā)現(xiàn)異常，但柯南認(rèn)為案件定有蹊蹺，經(jīng)過(guò)反復(fù)調(diào)查和設(shè)想，他終于明白了犯人的作案手法。

柯南和步美他們一起玩捉迷藏的游戲，步美躲在一輛車的后車廂中，沒(méi)想到竟然睡著。元太一直都找不到步美，最后柯南終于用無(wú)線電和她聯(lián)絡(luò)上了步美，但步美卻在車的后備箱中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)人頭！剛好此時(shí)有件連續(xù)綁架少女殺人事件，柯南懷疑那輛車的兩個(gè)男人就是那個(gè)事件的歹徒。為了救出步美柯南通過(guò)步美的描述利用滑板開始追蹤步美。最終柯南成功追上了步美但所謂的連續(xù)殺人犯卻是誤會(huì)一場(chǎng)。

暮目警官趕來(lái)寺院展開調(diào)查，就在大家一籌莫展準(zhǔn)備離開時(shí)，獨(dú)自調(diào)查的柯南從被強(qiáng)大力量打破的墻壁、切口變形的走廊木板、被丟在樹林里的角窗碎片和膠帶中洞察到了兇手的犯案手法，以及兇手就在四個(gè)修行僧當(dāng)中，他用阿笠博士給他的紐扣擴(kuò)音器道出真相，而兩年前以同樣手法殺死修行僧忠念的居然另有其人。

阿笠博士帶少年偵探團(tuán)來(lái)到野外，并交給他們一張地圖讓他們?nèi)ふ覍毑兀飞侠щy重重，但大家不畏艱險(xiǎn)互相扶持，終于接近終點(diǎn)，柯南解開天之水與天之石的暗語(yǔ)，順利找到了藏有寶物的底下通道，這里有兩大袋珠寶，然而在途中碰到過(guò)的兩個(gè)行跡可疑的男人突然出現(xiàn)，柯南采用智斗將他們打到后，又發(fā)現(xiàn)了一個(gè)大木箱，這才是阿笠博士想讓他們找到的寶藏。

少年偵探團(tuán)，在機(jī)緣巧合下和最受歡迎組合TWO-MIX的主唱高山美奈美一起吃飯，高山為找搭檔永野椎菜，一人跑出了演唱會(huì)的會(huì)場(chǎng)。后來(lái)在餐廳外，歹徒當(dāng)著柯南的面將高山推入車中綁架，他們要求少年偵探團(tuán)拿著TWO-MIX最新的歌曲練習(xí)帶去交換人質(zhì)，歹徒在電話里讓少年偵探團(tuán)把警察甩掉并讓步美一人前去，于是柯南和步美調(diào)換身份。