看似自殺的案件還存在著很多疑點(diǎn)，現(xiàn)場(chǎng)留下的物件和快速轉(zhuǎn)臺(tái)的情況讓柯南明白了作案手法，而能夠作為決定性證據(jù)的物品還藏在真正的兇手身上。奶奶受到的訊息讓恩田的謊言不攻自破，而作為冒牌小五郎的他正處于尷尬的境地，察覺到背后隱情的柯南并不準(zhǔn)備揭穿他，柯南還準(zhǔn)備讓這個(gè)冒牌的小五郎展現(xiàn)名推理指出真正的兇手。

柯南一行人在阿笠博士的陪同下一起去山上露營(yíng)，在柯南和博士前去買東西時(shí)碰巧遇到了世良真純。另一方面，在山上撿拾柴火的灰原等人碰到了正在掩埋尸體的可疑人物，無(wú)法與柯南聯(lián)系的他們只能逃到了山中的小木屋內(nèi)，但讓他們沒想到的是這里便是兇案的事發(fā)現(xiàn)場(chǎng)，在柯南等人開始調(diào)查三個(gè)有嫌疑的人時(shí)小木屋卻燒起來(lái)了。

和笹本小姐一起晨跑的高木警官在路上撿到了一個(gè)皮包，打開之后里面竟是3千萬(wàn)的巨額鈔票，沒過多久鈔票的失主平沼先生便來(lái)到了警局。經(jīng)過調(diào)查之后高木警官發(fā)現(xiàn)平沼先生丟錢的時(shí)間有所出入，仔細(xì)觀察后的柯南得出了結(jié)論，平沼先生是在早上故意將錢放在路上，而他想把錢交給的則是有著晨跑習(xí)慣的笹本小姐，但他的用意卻讓眾人很困惑。

撿到地圖上的四個(gè)記號(hào)讓光彥等人認(rèn)為將會(huì)有案件發(fā)生，少年偵探團(tuán)再次出動(dòng)逐戶去敲門提醒，而這四戶中的香月先生卻意外身亡。調(diào)查回來(lái)的柯南遇到了發(fā)現(xiàn)香月先生的小狗酷兒，趁光彥等人不注意而被偷走的地圖正是酷兒的主人八木澤先生為了遛狗理由而畫下的，偷走這樣地圖的無(wú)疑就是這次事故的兇手，而關(guān)鍵詞則是香煙。

少年偵探團(tuán)利用連休來(lái)到了京都，他們是為了乘坐神盾艦體驗(yàn)航海的樂趣，但跟著他們一起前來(lái)的園子、小蘭和小五郎卻對(duì)小吃和酒更感興趣。京都的日式甜點(diǎn)是小蘭非常喜歡的甜點(diǎn)，但她購(gòu)買的老店中卻沒有了巧克力口味，慌忙跑進(jìn)來(lái)的社長(zhǎng)竟然稱所有分店的巧克力口味都憑空消失了，聽到小五郎名號(hào)的社長(zhǎng)急忙拜托調(diào)查。