柯南和少年偵探團(tuán)幾天來(lái)一直覺(jué)得元太的舉止怪怪的，便追問(wèn)元太，元太說(shuō)他因?yàn)槟繐袅诉B續(xù)搶劫案的罪犯而正被追殺，這時(shí)從商場(chǎng)頂樓有鐵材向元太落下來(lái)讓原本以為只是元太想多了的柯南眾人也認(rèn)真起來(lái)了。元太聲稱(chēng)見(jiàn)到連續(xù)強(qiáng)盜犯卻忘記在哪里看到的。在不斷的回憶前幾天的事情之后少年偵探團(tuán)的各位終于找到元太看到盜賊犯。

倫太郎家的餐廳來(lái)了一個(gè)叫龜倉(cāng)雄二的人，在他以報(bào)恩為目的來(lái)到這里之后，倫太郎家原本的冷清的餐廳因龜倉(cāng)的努力而漸漸生意興隆起來(lái)，可倫太郎總覺(jué)得事情沒(méi)那么簡(jiǎn)單，便拜托少年偵探隊(duì)進(jìn)行調(diào)查。龜倉(cāng)以想菜單為由總把自己關(guān)在屋子里，這讓柯南等人覺(jué)得很可疑，這時(shí)，光彥想到了福爾摩斯里的紅番聯(lián)盟案件，于是大家便以這個(gè)案件為參考展開(kāi)了調(diào)查，柯南認(rèn)為光彥等人的推理都不可靠，然而事情的真相卻將柯南狠狠打擊了一番。

少年偵探隊(duì)本來(lái)是跟著阿笠博士一起出來(lái)露營(yíng)，沒(méi)想到居然在森林中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)鐘乳石洞穴，柯南四人立刻進(jìn)洞探險(xiǎn)，卻在這里碰到了一伙兒搬運(yùn)尸體的歹徒，而柯南為了掩護(hù)大家逃跑中彈受傷，之后，便血流不止，元太背著柯南尋找出口，可身后的歹徒也循著聲音疾步追來(lái)，失去了柯南的指引，少年偵探團(tuán)剩下的三人會(huì)采取什么樣的行動(dòng)？

柯南在調(diào)查橘律師釣魚(yú)的小船之后發(fā)現(xiàn)可疑的痕跡和莫名遺失的船錨。之后衫村小姐說(shuō)出熊田達(dá)也事情的真相。在看到約翰的狗屋的牌子之后柯南發(fā)現(xiàn)了兇手的身份。利用小五郎的沉睡，柯南向眾人闡述了兇手利用潮水漲落的犯罪手法和殺害熊田達(dá)也的發(fā)法。而兇手也主動(dòng)承認(rèn)了罪行并道出了殺人的理由。

打算盜取鈴木財(cái)閥家的黑珍珠BLACK STAR的怪盜基德，想起了以前關(guān)于鐘臺(tái)的一個(gè)事件，那是工藤新一和怪盜基德的第一次交手。另一方面，小五郎的事務(wù)所里收到一封附有支票的不明發(fā)信人的信函，并且在其上方還有一行奇怪的話語(yǔ)。