某日，一個叫上田丈二的醫(yī)師找到小五郎，拜托他調(diào)查自己的朋友吉村遭到不明人士恐嚇的事情，當(dāng)他們來到吉村所在的公寓剛準(zhǔn)備上樓時，突然聽到有東西墜落的聲音，柯南急忙跑去，卻發(fā)現(xiàn)吉村的尸體，目暮警官趕來之后，對吉村的公寓進(jìn)行了仔細(xì)的調(diào)查，而柯南卻將注意轉(zhuǎn)移到了住在六樓的上田身上。

柯南、小蘭和小五郎回家的路上，看到一間公寓里有人發(fā)生了爭吵，正準(zhǔn)備上前阻止時，一位老人說這種爭吵已成家常便飯，不用理會。然而，第二天居然在這間公寓里發(fā)現(xiàn)了尸體，就在小五郎懊悔沒能救人時，事務(wù)所突然沖進(jìn)了一位叫中本的年輕人，他聲稱自己是無辜的，雖然昨晚看似自己和死者在一起發(fā)生了爭吵，可這根本就是死者所演的獨(dú)角戲，隨后小五郎又找到了能證明他清白的錄音帶，本以為一切塵埃落定，柯南卻發(fā)現(xiàn)了其中的蹊蹺。

少年偵探隊(duì)本來是跟著阿笠博士一起出來露營，沒想到居然在森林中發(fā)現(xiàn)了一個鐘乳石洞穴，柯南四人立刻進(jìn)洞探險(xiǎn)，卻在這里碰到了一伙兒搬運(yùn)尸體的歹徒，而柯南為了掩護(hù)大家逃跑中彈受傷，之后，便血流不止，元太背著柯南尋找出口，可身后的歹徒也循著聲音疾步追來，失去了柯南的指引，少年偵探團(tuán)剩下的三人會采取什么樣的行動？

小五郎接受電視節(jié)目制作公司社長古川悅子的委托去保護(hù)他的母親。然后在古川家等待悅子回來的時候知道了家屬和女傭之間發(fā)生了很多金錢上的糾紛。悅子回來后去母親的房間叫母親時從母親的房間傳來了槍聲。悅子的母親被擊中頭部死亡。經(jīng)過調(diào)查，柯南發(fā)現(xiàn)了兇手殘留下來的證據(jù)正是遙控器上指紋的漏洞。最終兇手承認(rèn)了自己的罪行。

柯南，小蘭與小五郎向著溫泉的途中，在遭苛政君主殺害的戰(zhàn)國武將沖滑秀友的墓前祭祀時。正巧結(jié)識了住在這里的一戶人家。還聽說了關(guān)于秀友鎧甲的詛咒的傳聞。接著那天夜里。也正是秀友500年祭日的那晚，還知道了當(dāng)天也是這家人家中的父親因工廠倒閉即而自殺，即這個鎧甲原來的主人的祭日。