妃英理找到企圖辭職的九條檢察官，并告訴她竹內(nèi)的死并非自殺而是經(jīng)過策劃的謀殺案件，得知此事九條檢察官?zèng)Q定和妃英理一起在法庭上將真相公之于眾。審判過程中，小五郎以辯方的特別證人出現(xiàn)，他不但說明了竹內(nèi)夫婦早已名存實(shí)亡的婚姻，還將五年前竹內(nèi)違法建筑案的內(nèi)幕也說了出來，然而最關(guān)鍵的竹內(nèi)死亡之謎還是由柯南道出真相！

當(dāng)晚，這名潛入醫(yī)院的黑暗組織同伙南田陸道果然展開了行動(dòng)，但同時(shí)FBI也暴露了行動(dòng)，南田陸道在驅(qū)車逃跑的過程中舉槍自盡，雖然柯南破壞了他的手機(jī)但他還是通過其他手段將搜集來的信息傳給了組織。既然事情發(fā)展到這種地步，轉(zhuǎn)院無疑就是在向黑暗組織昭示水無憐奈就在這里，所以只能另想對(duì)策。另一方面，英祐伺機(jī)潛入了水無憐奈的病房，并發(fā)現(xiàn)她早已從昏迷中蘇醒。

步美發(fā)現(xiàn)圖書館的書被人撕掉了一頁，氣憤的她決定找出“元兇”，根據(jù)借書卡的記載，柯南和步美找到了內(nèi)藤司，可他今天卻沒上課，與此同時(shí)，學(xué)校的巖石標(biāo)本也人被偷偷走，柯南認(rèn)為這可能是司所為，于是找到了他家，在查看了司的房間后，他們發(fā)現(xiàn)了一張寫有暗號(hào)的字條，少年偵探團(tuán)集結(jié)智慧，終于在大濱海灘找到了想要喚回逝去母親的司。

警方仍然將嫌疑犯關(guān)在一起進(jìn)行偵訊，期間秘書和英文補(bǔ)習(xí)班的老師暫時(shí)離開，就在他們離開后，柯南掌握到了關(guān)鍵線索，他讓木暮警官準(zhǔn)備四把椅子并對(duì)他們說一句“咒語”，到時(shí)候，兇手自然會(huì)露出馬腳，到底是什么樣的“咒語”？?jī)词钟质沁@四名嫌疑人中的哪一個(gè)？與此同時(shí)，明知會(huì)有危險(xiǎn)的赤井秀一還是按照水無憐奈所發(fā)的地址前去赴約。

小五郎、柯南、小蘭和白鳥一行人應(yīng)本城之邀，前來參加葡萄酒協(xié)會(huì)會(huì)長廣瀨的70歲壽宴。宴會(huì)開始前，柯南和小蘭兩人遇到了發(fā)生爭(zhēng)執(zhí)的本城和赤丸，并且在搭乘纜車的時(shí)候，柯南還目睹了本城殺害赤丸的場(chǎng)景，于是，他迅速趕往現(xiàn)場(chǎng)，卻發(fā)現(xiàn)尸體早已被本城轉(zhuǎn)移。然而，品酒環(huán)節(jié)的一個(gè)紕漏，讓柯南推斷出了事情的真相，他巧妙用計(jì)將本城的罪行公之于眾。