柯南回家后小蘭就告訴他，自從放寒假瑛祐就失去了聯(lián)系，而在此之前小蘭從他那里聽(tīng)說(shuō)，他好像在杯戶(hù)中央醫(yī)院找姐姐的時(shí)候發(fā)現(xiàn)了關(guān)于自己父親線(xiàn)索，柯南急忙找到茱蒂老師商量對(duì)策，并推斷出他的父親就是被黑暗組織殺掉的CIA諜報(bào)人員，隨后，柯南一行人趕到醫(yī)院向護(hù)士詢(xún)問(wèn)英祐的事情，沒(méi)想到竟然還有另一個(gè)人像英祐一樣在這家醫(yī)院打聽(tīng)水無(wú)憐奈的事情。

小說(shuō)家萬(wàn)田年久在旅館里趕寫(xiě)小說(shuō)，在編輯島木催稿離開(kāi)房間后，萬(wàn)田化裝成服務(wù)生，帶著貓咪諾貝爾離開(kāi)了旅館。萬(wàn)田路過(guò)柯南等人打簡(jiǎn)易棒球的場(chǎng)地，進(jìn)入了弟子原本高平的家。萬(wàn)田從代理作者原本那里得到原稿后，將其殺害了。而偶然將球打入的柯南一行進(jìn)入房間后發(fā)現(xiàn)了被殺的原本。柯南則發(fā)現(xiàn)了萬(wàn)田的不自然。

佐藤警官左手無(wú)名指上突然多出的戒指引起了同事們的關(guān)注，連高木也不知這枚戒指的由來(lái)，就在他為自己的幸福擔(dān)憂(yōu)時(shí)，佐藤接到了小蘭的報(bào)警電話(huà)，死者是作家諸口益貴，發(fā)現(xiàn)尸體時(shí)他正處在一間上鎖的密室房間，判斷出死者是自殺還是他殺成了破案首要解決的問(wèn)題，柯南發(fā)現(xiàn)這個(gè)謹(jǐn)小慎微的作家把戒指戴反了，由此推斷，這是起他殺事件，可犯人到底用了什么手法來(lái)制造密室？

小林老師在圖書(shū)館里發(fā)現(xiàn)了一個(gè)牛皮錢(qián)包，那里放了小學(xué)一年級(jí)時(shí)小蘭留的字條。事情追溯到十年前，為證實(shí)謠言的真假，小蘭和新一夜訪(fǎng)校園，不想?yún)s在學(xué)校圖書(shū)館遇到了一個(gè)自稱(chēng)是新一弟弟的神秘男子，他向新一發(fā)出挑戰(zhàn)并在留下了一個(gè)裝有暗號(hào)的牛皮錢(qián)包后離開(kāi)。于是，新一和小蘭二人就在阿笠博士的幫助下展開(kāi)了解謎暗號(hào)的尋寶之旅！

從其他人的談話(huà)中，柯南得知在這起爆炸事件發(fā)生之前，曾經(jīng)也有油桶被打翻的情況，并且周藤豪貴死前所穿的衣服是未婚妻銀林惠奈所送的羊毛衫，根據(jù)這些線(xiàn)索再加上灰原無(wú)意的提示，柯南將兇手鎖定，他以警方要錄口訊為由將不知情的兇手帶走，并在車(chē)庫(kù)中重現(xiàn)犯案時(shí)所用的手法讓她自己露出了馬腳。