鋼琴奏鳴曲《月光》殺人事件(上集)麻生圭二的人邀請(qǐng)來(lái)到月影島，打聽(tīng)之后得知此人十二年前就在貝多芬的《月光》曲中詭異死去，至今島上還流傳著關(guān)于鋼琴詛咒的流言，因?yàn)榍叭未彘L(zhǎng)就是死在鋼琴旁。柯南等人來(lái)的當(dāng)天，正趕上前任村長(zhǎng)的法事，突然鋼琴聲響起，大家沖進(jìn)琴房后，看到的是資產(chǎn)家川島先生的尸體。暮目警官到達(dá)的當(dāng)晚，現(xiàn)任村長(zhǎng)也被人刺死，身旁還留下了音符的暗號(hào)。

柯南和小伙伴們?cè)诤永镒ヴ~(yú)時(shí)，發(fā)現(xiàn)對(duì)面的樓頂有人在射擊河上的氣球，并看到狙擊手像是被人脅迫了一樣，待那些人離開(kāi)之后，柯南和伙伴們?cè)趯?duì)面的樓頂找到了留有3135134162數(shù)字的計(jì)算器，之后柯南便對(duì)著這些數(shù)字苦思冥想，認(rèn)為求救者留下的162就是指162國(guó)道，找到相應(yīng)的路段后，警察布好埋伏，卻不見(jiàn)犯人身影，焦急等待的柯南突然意識(shí)到了暗號(hào)的真正含義。

麗花身上有被捆綁的痕跡，柯南在調(diào)查中扭開(kāi)水龍頭的時(shí)候，發(fā)現(xiàn)水居然是從蓮蓬頭流出，確定了兇手之后，接下來(lái)就是找證據(jù)，柯南麻醉小五郎，借助小五郎的聲音讓三船、五條、六田、一枝脫下外套，更加確定了自己的推測(cè)，在黑暗的別墅中，柯南指出兇手，而兇手的殺人動(dòng)機(jī)則源于兩年前。

少年偵探團(tuán)在海灘度假的時(shí)候，偶然認(rèn)識(shí)了春日財(cái)團(tuán)的大少爺和他的女朋友小忍。元太玩球時(shí)撿到了小忍發(fā)出的SOS求救漂流瓶，順著漂流瓶的方向，他們?cè)谝粋€(gè)洞窟找到小忍，原來(lái)這都是春日的安排，眼看海水滿潮，無(wú)法原路返回，大家在柯南的指揮下順利從洞穴另一邊逃出，看到小忍還活著，春日露出丑惡嘴臉以步美為人質(zhì)，關(guān)鍵時(shí)候小蘭趕來(lái)，將春日制服。

柯南和伙伴們?nèi)ッ佬g(shù)館時(shí)撿到了一張畫(huà)有奇怪符號(hào)的紙，大家自行成立少年偵探團(tuán)去調(diào)查這些暗號(hào)，按照符號(hào)的指示先到達(dá)東京塔，在周?chē)归_(kāi)偵查卻一無(wú)所獲，休息的時(shí)候步美的新發(fā)現(xiàn)為柯南找到破解暗號(hào)的出口，大家一路尋找從東京鐵塔到南部水族館的標(biāo)記，然而，事情并非那樣順利，柯南能破解暗號(hào)嗎？暗中跟蹤少年偵探團(tuán)的黑衣人又是誰(shuí)？