少年偵探團、灰原與柯南等人發(fā)現(xiàn)小說家萬田年久的弟子原本高平在家中遇害。目暮調(diào)查了死亡推定時間內(nèi)的不在場證明。萬田說他從昨晚起一直把自己關(guān)在旅館的房間內(nèi)、案發(fā)時也沒出過房間。高木發(fā)現(xiàn)旅館和原本家確實很近。可是，島木說自己確實在旅館的候梯廳等萬田，而萬田的貓最終暴露了他犯罪的事實。而最終萬田也承認了自己的罪行。

鈴木次郎吉宅邸中的大保險柜——鐵貍是由幕末的機關(guān)師三水吉右門衛(wèi)制造的無法攻陷的最強保險柜。針對鐵貍，怪盜基德拋出了挑戰(zhàn)書，揚言自己將打開那個擊退了無數(shù)盜賊的堅固門扉，然而在鐵貍外，次郎吉還安裝了與重量傳感器聯(lián)動的防盜裝置，任誰想要接近保險柜都極其困難。在預告作案的當天，中森警官率領(lǐng)警隊進行了嚴密的布防，可是基德的第二封預告信還是出現(xiàn)在了保險柜前，難道他已潛入宅邸？

小五郎，蘭，柯南一行人受到虎田直信的委托，負責調(diào)查他的兒子義郎離奇死亡的案件，與此同時，服部在虎田的死對頭龍尾家調(diào)查他兒子康司的死亡，與義郎相同，康司的尸體旁也擺放了一只死蜈蚣。當晚，和葉和小蘭看到了身著鎧甲的戰(zhàn)敗武士的影子，得知此事后，龍尾家的綾華神大驚失色跑了出去，而發(fā)現(xiàn)她的時候，她已經(jīng)被吊死在一顆樹上，腳下同樣出現(xiàn)了一只死蜈蚣。

柯南回家后小蘭就告訴他，自從放寒假瑛祐就失去了聯(lián)系，而在此之前小蘭從他那里聽說，他好像在杯戶中央醫(yī)院找姐姐的時候發(fā)現(xiàn)了關(guān)于自己父親線索，柯南急忙找到茱蒂老師商量對策，并推斷出他的父親就是被黑暗組織殺掉的CIA諜報人員，隨后，柯南一行人趕到醫(yī)院向護士詢問英祐的事情，沒想到竟然還有另一個人像英祐一樣在這家醫(yī)院打聽水無憐奈的事情。

死者鍛吾是被人捆綁溺斃在泳池中而死，他的一只手上還戴有前管家的手套，作為父親的角藏認為兇手就是這棟宅邸中的某個人，聞聽此言，小五郎便做出不可能是家人犯案的結(jié)論，可是當晚，角藏的房間里就傳出花瓶摔碎的聲音，當大家趕到時，角藏已上吊身亡，在案發(fā)現(xiàn)場高木警官發(fā)現(xiàn)疑似角藏所留下的死亡訊息。