京城里彌漫著一種神秘香氣，由于來勢突然朝廷內外俱驚。乾隆命和珅迅速查明香氣源頭。一神秘女人，自稱知道香氣由來，原來紀曉嵐為了撰寫《四庫全書》而廣征天下藏書，好友顏驥踴躍獻書。和珅卻大興文字獄。乾隆在和珅的煽動下，將顏驥全家賜死。紀曉嵐無力回天，只有將顏驥生前收藏的西域煙草點燃，以此明志要為顏驥討回公道，也正是此獨特香氣使全城大亂。昔日神秘女子正是顏驥流落在民間的私生女顏如五。如玉認為一切都因紀曉嵐而起，決定替父報仇，紀曉嵐扮作戲子，在戲臺之上拿出乾隆賜予的金煙桿，表明要為顏驥翻案的決心。

紀曉嵐不肯循親枉法，力數薛大老板之罪狀，皇上無言以對，和巧言令色，深通馬屁術和離間術，莫愁聞知老夫人既是貪案的罪魁禍首，想到為此犧牲的黃克明，舉劍直指老夫人，并慷慨陳詞，欲報仇血恨，皇上深為震驚，迫于情勢，決定親自出馬，弄清案情，查明真相。 紀曉嵐與和天生一對冤家對頭，一旦相見，便免不了冷嘲熱諷。和建議以無關緊要的人物做替罪羊洗清柳志夫人的污點，紀曉嵐豈相從，柳志夫人痛訴多年來失子之痛，才為彌補失落感，用金錢報仇世人。皇上矛盾不已，紀曉嵐毫不手軟，斷然判案，不惜身家性命。柳志夫人自知罪孽重，不忍再為難皇上毅然服毒自盡。 一日，紫禁城內，君臣又聚在一起，為奶娘命案一事產生歧義，和深知此案頗多詭異，不愿輕易牽掛上身，紀曉崗卻明察秋毫，知此中大有文章，正欲深入調查，御醫呂長安卻越獄逃跑。

皇上自號“許仙”來到公堂上，主動作證，“指鹿為馬”和不敢再做“和”，在燕城官員面前狼狽不堪，紀曉嵐揚眉吐氣，乘勝追擊。和遭戲弄，不敢公然發作，只得指桑罵槐，以泄私憤。為了搞清貪案主犯大通錢莊的薛老板真實身份，二人不免還要再來一次口舌之爭。 劉志婦人多年來忍受相思之苦，如今母子團圓，可謂喜從天降，但也不愿給皇上的前程添麻煩，力勸兒子以國為本，速速返回京城。與此同時，福康安暗送十四王爺一道可以暢通無阻之令牌，謀害之心不死。為促使王爺及早離開，四姑娘加意接受福的感情。 小月女扮男裝，奉紀氏之命，率官兵查封私自囤糧，謀取暴利的不法奸商薛大老板的店鋪，不想薛大老板竟是剛剛與皇上母子相認的柳志夫人，柳志夫人不甘示弱，亦婉轉點出與“許仙”的特殊關系，把難題留給了毫無心理準備的紀曉嵐，和為此暗中得意。 是屈從皇親國戚，枉國家之法，還是剛直不阿，徹底追查元兇，考驗紀曉嵐的不僅有心存負疚庇護生母的皇上，更兼那挑撥離間，趁機誣陷的和，他該何去何從呢？

張了了慌稱要去探望戲園的師傅，紀曉嵐感到好奇，便跟隨前往，眼見張了了進了戲園，紀曉嵐無功而返。等候在戲園里的劉全將和珅的指示吩咐給張了了，要其依計行事，念及柳哥的安危，張了了含淚答應。張了了為南下購置了許多東西并賒了賬。小月和杏兒偷聽到盧焯命令盧安用郭天的女兒瑤琴要挾郭天冒認罪行，一蒙面人擲石提醒盧焯，小月和杏兒追趕，卻遇到了張了了，引起小月起疑。瑤琴和丫鬟春桃在進香時遭到盧安的劫持。紀曉嵐讓小月前去搭救瑤琴，和珅找尋至此，意欲勸紀曉嵐放盧焯先走，紀曉嵐巧妙利用于丑交替之時，將決定權推到和珅身上。

書院承諾，只要考上本院便可分文不收，還保證中舉。正在紀曉嵐驚詫之時，窮書生徐有慶闖進考場，痛斥科舉考試的黑暗之處。紀曉嵐感嘆徐有慶才智兼備。經小月打探，此書院的贊助人為“驢肉先生”。紀曉嵐堅信其中有蹊蹺，決定追查下去。紀曉嵐與小月在一驢肉館遇到在此做工的徐有慶，徐有慶表示當今科舉考試已成為牟利賺錢的營生，清白的讀書人都以此不齒。紀曉嵐帶和珅來到坐落于驢肉胡同的和珅故邸，回想舊日辛酸，和珅承認自己就是驢肉先生以及自己愛才助才的苦心，并將紀曉嵐帶至書院。紀晚嵐驚訝地發現徐有慶就在其中，但言語卻猶如陌生人。紀曉嵐設局，讓乾隆假扮店小二以聽到和珅興辦書院的目的。和珅坦言，興辦書院只為培養自己勢力，治學是假，謀私是真。乾隆大怒，罰和珅承擔此次恩科考生的所有費用，并讓紀曉嵐頂替和珅管理書院。和珅到處去宣揚自己傾囊治學。當得知乾隆親自命題時，和珅買通乾隆身邊的太監王喜偷題。