柯南和小蘭跟著小五郎來(lái)到關(guān)門(mén)海峽，還在這里認(rèn)識(shí)四個(gè)高中時(shí)代就是同學(xué)的年輕人，沒(méi)想到第二天，他們的另外一名高中同學(xué)真尾被人發(fā)現(xiàn)橫尸關(guān)門(mén)橋下，起初警方懷疑兇手就在與死者見(jiàn)過(guò)面的那四名同學(xué)中，然而他們都有不在場(chǎng)證明，偵訊過(guò)后四個(gè)人都擺脫了嫌疑，但柯南卻發(fā)現(xiàn)了破綻。

帝丹高中最近發(fā)生了不可思議的靈異事件，小蘭本想拜托小五郎調(diào)查卻被拒絕，所以由柯南出馬破解校園靈異事件之謎。期間，小蘭他們還遇到新出醫(yī)生，于是一行人在園子的帶領(lǐng)下首先來(lái)到了體育館，這里曾莫名的出現(xiàn)了兩年前就已死去的保坂的書(shū)桌，接著又來(lái)到了詭異的圖書(shū)館和導(dǎo)致保坂死去的樓梯，經(jīng)過(guò)一圈查看，柯南已大致明白，就在這時(shí)，操場(chǎng)中間突然出現(xiàn)了保坂的書(shū)桌……

平次，葉子終于安全到達(dá)小五郎的事務(wù)所，五人在吃飯的時(shí)候說(shuō)道最近都內(nèi)發(fā)生了連續(xù)發(fā)火事件，現(xiàn)場(chǎng)總會(huì)留下紅色的馬的人偶。次日，柯南等人造訪委托他們的諸角宅邸后亮子也以可能是自己多疑了為由放棄了委托。而在柯南他們監(jiān)視的過(guò)程中遇到了風(fēng)水師曾我和亮子的沖突。就在柯南眾人回去之后又再次發(fā)生了火災(zāi)而地點(diǎn)正是亮子的住處。

為了找到兇器柯南再次返回案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)進(jìn)行調(diào)查，并要求重新查看嫌疑人的證物，這時(shí)，他注意到了貼在地板上的走位標(biāo)記，并在這些膠帶下面發(fā)現(xiàn)了棉花，這些線索無(wú)疑讓他知道了兇器的位置以及兇手的犯案手法，正當(dāng)他準(zhǔn)備麻醉小五郎時(shí)，卻發(fā)現(xiàn)麻醉針已經(jīng)沒(méi)有了，他只能直接給小五郎提供線索，沒(méi)想到小五郎竟然單獨(dú)找瑠璃談話，難道他懷疑瑠璃，所以要?jiǎng)袼允祝?/p>

少年偵探隊(duì)在調(diào)查連續(xù)闖空門(mén)事件的時(shí)候，一幢公寓里突然傳出女聲尖叫，原來(lái)這名叫細(xì)野的小姐在買(mǎi)回來(lái)的二手沙發(fā)里發(fā)現(xiàn)了一具女尸，警方懷疑是她就是兇手，但細(xì)野卻有不在場(chǎng)的證明，這時(shí)，她的鄰居德永先生剛好回來(lái)，他說(shuō)昨天聽(tīng)到細(xì)野房中有爭(zhēng)執(zhí)的聲音，為搜集更多線索，高木去了那家二手家具店調(diào)查，得知那個(gè)沙發(fā)其實(shí)是從細(xì)野家附近的垃圾堆撿到的，一切又回到原點(diǎn)，就在大家一籌莫展時(shí)，光彥說(shuō)他知道誰(shuí)是兇手……