小五郎和蘭和柯南住進(jìn)了建在山里的山莊。在那里住宿的客人中有“城市獵人”節(jié)目的演員砂岡和工作人員。小五郎和大家一起去燒烤，不久聽(tīng)到了槍聲，砂岡被殺害了。經(jīng)過(guò)調(diào)查每個(gè)人都有很充足的不在場(chǎng)證明，而調(diào)查證據(jù)也顯示兇手竟是從對(duì)面的懸崖開(kāi)的槍。柯南經(jīng)過(guò)分析后將兇手鎖定在三人之中。

小五郎等人乘坐B(niǎo)ONNET公交車(chē)，來(lái)到一個(gè)叫“影秋村”的地方，中途上同車(chē)的村民奧村喝了自己帶的茶后死亡了。小五郎和柯南自動(dòng)在“影秋村”展開(kāi)搜查。村民們就是否交給警察調(diào)查與警方發(fā)生了沖突。原來(lái)村民就是否將卡扭車(chē)作為觀光車(chē)分成了兩派而奧村作為反對(duì)派的代表同村長(zhǎng)為代表的贊成派一直有沖突。此時(shí)村長(zhǎng)船木出現(xiàn)并提出委托費(fèi)為100萬(wàn)日元的委托。之后柯南得知村子里7年前的事故。夜晚在尾隨塔子的柯南卻聽(tīng)到為了找他而進(jìn)入神社的蘭的尖叫聲！？

柯南在垃圾桶里發(fā)現(xiàn)了被丟掉的便簽紙，客房服務(wù)員也說(shuō)自己曾在門(mén)外發(fā)現(xiàn)了一張寫(xiě)有奇怪內(nèi)容的字條，這時(shí)，警方說(shuō)在兇器電話(huà)線(xiàn)上發(fā)現(xiàn)了小五郎的指紋，案件的偵破進(jìn)入了死胡同，兇手到底是誰(shuí)呢？妃英理隨意的一句話(huà)提醒了柯南，沒(méi)錯(cuò)兇手就是那個(gè)人！得知了真相以后，柯南、妃英理和警方聯(lián)手將兇手引入到他們?cè)O(shè)下的陷阱之中。

為了采集蘑菇少年偵探隊(duì)一行人全部進(jìn)了山里，忙著采菇的時(shí)候，元太竟然誤入狩獵區(qū)。無(wú)奈之下，大家只好兵分兩路分頭尋找，沒(méi)想到灰原和光彥居然發(fā)現(xiàn)被人獵殺的尸體，害他們自己反成了射殺的目標(biāo)。另一邊，找到元太之后，大伙兒便和三名獵人一起沿著山區(qū)的小路尋找灰原和光彥的蹤影。

光彥建議讓亞瑟聞道爾的味道幫忙找道爾，可亞瑟卻從和式里叼出一個(gè)坐墊，柯南發(fā)現(xiàn)和式里的坐墊比之前多了一個(gè)，他又將道爾聽(tīng)到時(shí)鐘之后發(fā)生的事情全部梳理了一遍，并且還在客廳的走廊上找到了曾經(jīng)出現(xiàn)在焚化爐里的玻璃棉，有了這些線(xiàn)索一切謎題迎刃而解，找到道爾之后，少年偵探分工合作，將它失蹤時(shí)的場(chǎng)景重演一遍，揪出了藏匿道爾的歹徒。