找到失蹤的貓咪后小五郎和柯南拿著酬勞準(zhǔn)備去吃飯，但他們卻突然聽(tīng)到尖叫的聲音，在樓下他們發(fā)現(xiàn)一對(duì)夫妻死在了家里。死在客廳里的是身中數(shù)刀的前原圣一，而他的妻子前原早紀(jì)則被捆綁在臥室的衣櫥里窒息死亡。警方探查之后認(rèn)為殺死圣一的正是他的妻子早紀(jì)，想要掩人耳目而把自己捆起來(lái)關(guān)入衣櫥的早紀(jì)卻遇到了意外，但真相真是這樣嗎？

日賣(mài)體育記者加賀爪弘和橋爪明曾在一年前報(bào)道過(guò)一篇關(guān)于大企業(yè)老板角山制作所的山角雄三社長(zhǎng)去世引發(fā)的遺囑失蹤事件，這兩位記者當(dāng)時(shí)不斷煽風(fēng)點(diǎn)火，將自己挖到的爭(zhēng)奪遺產(chǎn)的丑聞都刊登在雜志上害的親屬爭(zhēng)執(zhí)不斷最后甚至引發(fā)了殺人未遂案。柯南白天在餐館遇到了這兩名關(guān)系很差的記者，沒(méi)想到就在當(dāng)晚，加賀爪弘竟然被發(fā)現(xiàn)在河邊遇害。

根據(jù)圖畫(huà)書(shū)中的線索，柯南等人得知還有其他炸彈存在。目暮警官馬上出動(dòng)全體警力前去搜查，不料卻發(fā)現(xiàn)其余的炸彈都只是爆炸犯捉弄警方的惡作劇，而真正的炸彈早已按照計(jì)劃在指定地點(diǎn)爆炸。正當(dāng)調(diào)查一籌莫展時(shí)，目暮警官突然接到匿名電話(huà)報(bào)警，稱(chēng)自己發(fā)現(xiàn)了爆炸犯的藏身之處。而正當(dāng)眾人趕往此地時(shí)，據(jù)稱(chēng)是犯人居住的地方卻再一次發(fā)生了爆炸……

為了和靈魂偵探堀田凱人進(jìn)行對(duì)談，柯南跟著毛利小五郎來(lái)到了酒店，但到時(shí)發(fā)現(xiàn)堀田已被殺害，其隔壁房間的客人竟然是世良。柯南和世良在案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)進(jìn)行了一番調(diào)查，罪犯的手法與關(guān)鍵性的證據(jù)全被找了出來(lái)，就在柯南準(zhǔn)備和往常一樣進(jìn)行推理時(shí)卻發(fā)現(xiàn)自己的變聲器不見(jiàn)了，而這時(shí)竟有人很自然的用他遺失的變聲器開(kāi)始模仿小五郎的聲音進(jìn)行推理。

千葉警官在警局四處詢(xún)問(wèn)有關(guān)“不明飛行物”的線索，卻毫無(wú)所獲，這天他回到家，收到了聲稱(chēng)是自己宇宙第一大粉絲的人寄來(lái)的神秘郵件。在另一邊，名為和田陽(yáng)奈的女高中生來(lái)到毛利事務(wù)所，委托小五郎調(diào)查杯戶(hù)公園“UFO”一事。杯戶(hù)公園隔壁的杯戶(hù)高中發(fā)生殺人案件，這兩者是否有聯(lián)系？