在幫純子小姐調(diào)查入室偷竊的時(shí)候小五郎和柯南遇到了一起命案，死者是純子小姐的鄰居北上先生，初步判斷為酗酒墜樓，但在高木警官調(diào)查附近鄰居時(shí)柯南看出了端倪。所調(diào)查的房間里柯南看到了幾處線(xiàn)索，這些都可以說(shuō)明北上并非意外墜亡，但是柯南還是沒(méi)有找到關(guān)鍵的證據(jù)，小五郎在電梯里整理儀容時(shí)柯南突然明白了什么。

柯南所在的班里來(lái)了一位新老師名叫若狹留美，若狹老師想在體育課前用石灰畫(huà)線(xiàn)，卻發(fā)現(xiàn)石灰已經(jīng)用完了?？履细嬖V若狹老師舊倉(cāng)庫(kù)里可能有石灰，元太和光彥開(kāi)玩笑說(shuō)舊倉(cāng)庫(kù)有幽靈出沒(méi)，若狹老師感到很害怕，便拜托少年偵探團(tuán)一同前往舊倉(cāng)庫(kù)。在尋找石灰的過(guò)程中，柯南發(fā)現(xiàn)一扇通往地下的門(mén)，眾人合力打開(kāi)門(mén)后，卻驚人地發(fā)現(xiàn)了一具骸骨……

小蘭和園子聊著幼稚園時(shí)的往事，新一當(dāng)時(shí)所做出的櫻花名牌推理，正是他的第一次推理，而在小蘭不知道的情況下新一一直在背后默默地守護(hù)著她。櫻花班班主任江舟論介看小蘭的眼神讓新一非常在意，他認(rèn)為這個(gè)老師是故意想要和小蘭親近，他所作出的解釋看似合理，但新一依舊無(wú)法放松警惕，新一的父親工藤優(yōu)作得知后也展開(kāi)了調(diào)查。

這天，鐵頭、姜小牙和米小圈一起上學(xué)，當(dāng)時(shí)三個(gè)人優(yōu)哉游哉嘴里還啃著母親早上做的早餐，當(dāng)時(shí)米小圈還抱著一個(gè)大熱狗，正吃得津津有味，忽然一輛大卡車(chē)直接沖著他們?nèi)齻€(gè)人過(guò)來(lái)，當(dāng)時(shí)鐵頭和姜小牙嚇得哇哇大叫，米小圈離卡車(chē)最近，幾秒鐘的功夫，兩只眼睛一抹黑，直接栽倒在地上。等米小圈緩緩睜開(kāi)眼睛，發(fā)現(xiàn)自己與死亡擦肩而過(guò)，卡車(chē)翻倒在他旁邊，恰好留下一個(gè)空隙，這個(gè)空隙中就有米小圈，真是萬(wàn)幸中的萬(wàn)幸啊，米小圈從驚懼中爬起身，不遠(yuǎn)處，鐵頭抱著姜小牙也跌倒在地，姜小牙在地上坐起，發(fā)現(xiàn)自己在鐵頭的懷抱中毫發(fā)無(wú)損，頓時(shí)感激涕零，視鐵頭如再生父母，米小圈當(dāng)場(chǎng)就語(yǔ)塞，平日里與鐵頭形影不離，關(guān)鍵時(shí)刻鐵頭卻選擇了保護(hù)姜小牙。當(dāng)天，學(xué)校便因?yàn)殍F頭英勇救人的事情引起軒然大波，作為學(xué)校有名的通訊小記者何詩(shī)雨特意來(lái)到米小圈班級(jí)采訪(fǎng)調(diào)查，李黎艷羨地看著何詩(shī)雨，這個(gè)全校文明的小記者，不僅有傲嬌的外貌，并且頭腦及其靈活，每次寫(xiě)出的采訪(fǎng)稿都能夠轟動(dòng)全校，果真何詩(shī)雨采訪(fǎng)了米小圈班級(jí)同學(xué)，只撿對(duì)鐵頭有利的說(shuō)，用生動(dòng)形象的語(yǔ)言把鐵頭塑造成一個(gè)妥妥的小英雄。米小圈開(kāi)始和鐵頭疏遠(yuǎn)，鐵頭成了名人，卻一臉不開(kāi)心，好像總是一副畏首畏尾的模樣，放學(xué)了，鐵頭拉

綾乃在休息日應(yīng)邀來(lái)到了美冬家，誰(shuí)知在門(mén)口時(shí)卻聽(tīng)到了屋內(nèi)的爭(zhēng)吵聲以及美冬的慘叫，終于打開(kāi)門(mén)的綾乃只看到了美冬的尸體和房?jī)?nèi)凌亂的腳印。匆忙逃命的綾乃在路口撞上了柯南和毛利并帶他們來(lái)到了案發(fā)地，而當(dāng)柯南他們順著屋內(nèi)遺留的線(xiàn)索找到“兇手”田端時(shí)卻發(fā)現(xiàn)對(duì)方竟然已經(jīng)死亡。