東西南北四個(gè)代表簡(jiǎn)單做了自我介紹以后，就各自回房休息，吃飯的時(shí)候卻發(fā)現(xiàn)導(dǎo)播被人綁在形如密室的房間內(nèi)，所幸生命沒(méi)有受到威脅，就在大伙兒忙著尋找線索時(shí)，照顧他們起居的甲谷突然說(shuō)這是比賽的第一題，北部代表越水七規(guī)承諾一小時(shí)之后就能重現(xiàn)密室手法，等待期間南部代表時(shí)津潤(rùn)哉說(shuō)起了一年前的薰衣草殺人事件。時(shí)間一點(diǎn)點(diǎn)過(guò)去，越水遲遲不現(xiàn)身，待大家趕到時(shí)，他已死在了密室中。

兇器是房間工具箱里的錘頭，并且柯南還發(fā)現(xiàn)每個(gè)人的房間都有薰衣草和工具箱，到底是誰(shuí)做出這種安排？又是出于什么目的呢？既然是無(wú)人島，那么兇手一定就是這棟房子中的一人，之后柯南他們又對(duì)供電的小房子進(jìn)行了調(diào)查，然而根據(jù)所找的線索，柯南，服部和白馬探每個(gè)人鎖定的嫌犯都不相同，即便如真相也只有一個(gè)！

死羅神和服部一唱一和，兩人一起揭穿了假新一的身份并且還將當(dāng)年村長(zhǎng)及其妻子遇害一案再次向大家說(shuō)明，而這個(gè)死羅神自然也就是工藤新一本人。案件結(jié)束后，新一的身體再次發(fā)生變化，幸虧灰原的及時(shí)趕到，新一才保住了秘密不被發(fā)現(xiàn)，在驅(qū)車回家的途中，一輛車很危險(xiǎn)的在馬路上行駛，當(dāng)大家努力將其攔下后卻發(fā)現(xiàn)開(kāi)車的人已被人勒死。

為搜集線索，警方?jīng)Q定去死者摔下來(lái)的懸崖一探究竟，然而除了雪人什么也沒(méi)有，突然刮起一陣大風(fēng)，元太為拿回被風(fēng)吹走的手套跌倒在雪地上，他說(shuō)自己聞到了一股咸咸的味道，這無(wú)疑給柯南提供了一條重要的線索。就在警察要以意外事件了解此案時(shí)，阿笠博士叫所有人來(lái)到堆放雪人的地方，柯南將警察山村麻醉，躲在雪人身后將兇手使用的手法一一道來(lái)。

在FBI制定作戰(zhàn)計(jì)劃的同時(shí)黑暗組織就已經(jīng)展開(kāi)了行動(dòng)，他們以南田陸道的名義寄給FBI一盆花，就在柯南推測(cè)敵人的意圖時(shí)，杯戶中央醫(yī)院突然涌來(lái)大波病患，這無(wú)疑也是黑暗組織的安排，在處理完花盆里埋的炸彈后，醫(yī)院陸續(xù)出現(xiàn)送貨員，而這些貨物全部都是黑暗組織送的炸彈，如果醫(yī)院爆炸，后果不堪設(shè)想，柯南和赤井秀一又會(huì)采取什么行動(dòng)？