柯南和灰原把撿到的貓還給飼主石上時(shí)，對(duì)面的高利貸事務(wù)所發(fā)生了命案，死者正是事務(wù)所的老板，他的后腦勺因遭到招財(cái)貓的重?fù)舳溃履习l(fā)現(xiàn)吸塵器的集塵袋被人拿走，并且還在沙發(fā)下找到了招財(cái)貓的爪子，警方將出現(xiàn)在現(xiàn)場(chǎng)的村井千佳小姐帶來(lái)，一番詢(xún)問(wèn)，村井承認(rèn)了自己的罪行，就在警察準(zhǔn)備帶走犯人時(shí)，柯南將小五郎麻醉道出了這件命案的真兇！

放課后，小林老師神神秘秘的讓同學(xué)們都離開(kāi)教室，待大家午餐完畢返回教室，卻發(fā)現(xiàn)黑板上留有一張“怪人二百面相”的字條，柯南一眼就看穿了這個(gè)江戶(hù)川亂步迷老師的意圖，之后，同學(xué)們又紛紛從自己的抽屜里找到了數(shù)字和篩子的圖紙，柯南輕松看出暗號(hào)的所指，就在他要揭秘時(shí)卻被廣播叫走，解謎的重任就交給了1年B班所有同學(xué)，沒(méi)有柯南的幫助，他們能否解開(kāi)暗號(hào)找到老師呢？

在找到的眾多刀具中，并沒(méi)有發(fā)現(xiàn)婆婆半夜所打磨的刀，并且阿笠博士發(fā)現(xiàn)自己帶來(lái)露營(yíng)用的錘子也不見(jiàn)了蹤跡，就在柯南思考兇手為何拿走錘子時(shí)，步美正準(zhǔn)備向魚(yú)缸里倒水，他也由此而注意到了水位的下降，斷定兇器就在魚(yú)缸中，那么兇手就一定是他！期間，柯南還發(fā)現(xiàn)了婆婆幾十年前就離家的孫子翔太，許久未見(jiàn)，孫子又會(huì)以什么樣的表情面對(duì)婆婆呢？

著名畫(huà)家及川武賴(lài)四部曲作品當(dāng)中的最后一幅《青嵐》被怪盜基德盯上，柯南、小五郎也因此被請(qǐng)到了及川府，然而那幅畫(huà)竟然在設(shè)有監(jiān)視器的畫(huà)室里瞬間消失不見(jiàn)，與此同時(shí)，及川的岳父風(fēng)景畫(huà)大師神原也被發(fā)現(xiàn)死在這個(gè)房間內(nèi)，難道兇手是從不殺人的基德？之后及川在柯南的后衣口袋中發(fā)現(xiàn)了基德留下的卡片，但柯南一眼就看穿了他的把戲，并推斷出基德就在四名警察之中。

柯南認(rèn)為這并非單純的自殺事件，期間一定存在兇手X，于是他匆忙跑去調(diào)查，與此同時(shí)，原本陪委托人床前小百合慢跑的小五郎也察覺(jué)到了蛛絲馬跡，當(dāng)他趕到與浦生良造初次見(jiàn)面的餐館時(shí)碰巧遇見(jiàn)了柯南，兩人一起尋找線(xiàn)索，雖然關(guān)鍵性的證據(jù)被暗中襲來(lái)的兇手搶走，但小五郎還是知道了兇手是誰(shuí)，面對(duì)真相與友誼，身為偵探的小五郎該做何選擇？