小五郎和柯南準(zhǔn)備外出吃飯的時(shí)候正巧看到了交通事故，駕駛車(chē)輛的是菊池俊明，而被撞死的人是他的熟人堤先生，看到堤的尸體后菊池痛哭流涕，而警方在堤的外套里找到了一封遺書(shū)，據(jù)此將這起事故作為自殺案件處理。菊池的舉動(dòng)和現(xiàn)場(chǎng)的細(xì)節(jié)引起了柯南的懷疑，他知道這并不是一起自殺案件。

這天，米小圈和其他隊(duì)員一起做野外拉練鍛煉體能，看著其他隊(duì)員跑得氣喘吁吁，米小圈又開(kāi)始耍起小聰明，他繞了道悄悄躲在一棵樹(shù)下看小說(shuō)，休息，終于聽(tīng)到吹哨的聲音，他才匆匆爬起來(lái)，臨走時(shí)還不忘將手里的礦泉水往臉上噴噴當(dāng)做汗水，米小圈做這些游刃有余，當(dāng)他和其他隊(duì)員一起“大汗淋漓”地跑回操場(chǎng)，隊(duì)長(zhǎng)不明就里還表?yè)P(yáng)他能夠堅(jiān)持?？吹疥?duì)長(zhǎng)翻開(kāi)隊(duì)員們號(hào)碼牌后面記錄的公里數(shù)，米小圈開(kāi)始懵逼了，很快隊(duì)長(zhǎng)看到米小圈只跑了三百步，當(dāng)著隊(duì)員的面毫不客氣地指責(zé)米小圈投機(jī)取巧，米小圈根本不服氣，他認(rèn)為既然是鍛煉體能，平時(shí)應(yīng)該多節(jié)省，等上比賽現(xiàn)場(chǎng)在揮汗如雨也不遲，大伙紛紛側(cè)臉，米小圈覺(jué)得自己根本沒(méi)錯(cuò)。果真，不久之后，他們與春華小學(xué)的對(duì)戰(zhàn)就開(kāi)始了，米小圈躍躍欲試，肌肉老師卻讓他有耐心，準(zhǔn)備讓米小圈在最后下半場(chǎng)進(jìn)入，并且當(dāng)做隊(duì)里的黑馬，米小圈聽(tīng)到肌肉老師如此重用他，心里非常得意。上半場(chǎng)春華小學(xué)以一比零的得分勝出，經(jīng)過(guò)短暫的休息調(diào)整后，秋實(shí)曉學(xué)的運(yùn)動(dòng)員開(kāi)始展現(xiàn)出優(yōu)勢(shì)，因?yàn)樗麄兤綍r(shí)比較重注體能訓(xùn)練，因此在后半場(chǎng)比賽中依然保持著雄厚的實(shí)力，眼看就要與春華小學(xué)的分?jǐn)?shù)追平，可是五號(hào)運(yùn)動(dòng)員卻因?yàn)椴恍⌒淖沔I手上受傷，終于被擔(dān)架抬下陣來(lái)。米小圈

綾乃在休息日應(yīng)邀來(lái)到了美冬家，誰(shuí)知在門(mén)口時(shí)卻聽(tīng)到了屋內(nèi)的爭(zhēng)吵聲以及美冬的慘叫，終于打開(kāi)門(mén)的綾乃只看到了美冬的尸體和房?jī)?nèi)凌亂的腳印。匆忙逃命的綾乃在路口撞上了柯南和毛利并帶他們來(lái)到了案發(fā)地，而當(dāng)柯南他們順著屋內(nèi)遺留的線索找到“兇手”田端時(shí)卻發(fā)現(xiàn)對(duì)方竟然已經(jīng)死亡。

柯南所在的班里來(lái)了一位新老師名叫若狹留美，若狹老師想在體育課前用石灰畫(huà)線，卻發(fā)現(xiàn)石灰已經(jīng)用完了。柯南告訴若狹老師舊倉(cāng)庫(kù)里可能有石灰，元太和光彥開(kāi)玩笑說(shuō)舊倉(cāng)庫(kù)有幽靈出沒(méi)，若狹老師感到很害怕，便拜托少年偵探團(tuán)一同前往舊倉(cāng)庫(kù)。在尋找石灰的過(guò)程中，柯南發(fā)現(xiàn)一扇通往地下的門(mén)，眾人合力打開(kāi)門(mén)后，卻驚人地發(fā)現(xiàn)了一具骸骨……

和柯南推測(cè)的一樣，17年前殺害羽田浩司的兇手就是那個(gè)從現(xiàn)場(chǎng)消失的名叫淺香的保鏢，其真實(shí)身份是黑暗組織的二把手朗姆，除了這些從羽田的死亡訊息中得到的線索外柯南一籌莫展。就在柯南思索的時(shí)候聽(tīng)到了電視臺(tái)打給毛利小五郎的電話，號(hào)稱(chēng)靈魂偵探的堀田打算破解羽田浩司的案件，但當(dāng)柯南和小五郎趕到指定賓館時(shí)又一起兇殺案發(fā)生了。