正在進(jìn)行的推理游戲卻變成了真正的殺人事件，在列車到達(dá)名古屋前柯南他們要在乘客中揪出真正的兇手來(lái)，在他們四處尋找線索的時(shí)候灰原卻忍受著內(nèi)心的煎熬。內(nèi)心忐忑不安的灰原正在受到組織的威脅，組織的黑影已經(jīng)更近一步接近灰原，她絕對(duì)不能以這種摸樣被人殺害。

案件解決后大龍警官卻并沒(méi)有要回到大阪的意思，發(fā)現(xiàn)大龍警官的異樣后柯南和平次等人一路尾隨來(lái)到了深山里的洋房，房里的兄弟姐妹們圍繞著遺產(chǎn)繼承話題明爭(zhēng)暗斗，洋房主人臥室里的棺材存在著諸多的疑點(diǎn)，小蘭和合葉在棺材里看到了駭人的一幕，整個(gè)事件籠罩在吸血鬼那毛骨悚然的氣息之中。

八號(hào)車廂里的殺人事件已經(jīng)偵破，而有希子與苦艾酒的對(duì)峙還沒(méi)有結(jié)束，在八號(hào)車廂制造火災(zāi)假象后等待著小哀的是波本。與苦艾酒所計(jì)劃的一樣，隨著列車的爆炸苦艾酒的任務(wù)也告一段落，正在品味勝利成果的她卻又看到了和少年偵探團(tuán)一起的小哀，這一切的背后還有所隱藏，前來(lái)協(xié)助柯南的究竟是何方神圣？

以幕末的長(zhǎng)崎為舞臺(tái)，有坂本龍馬擔(dān)任的偵探而活躍的推理劇，正在負(fù)責(zé)寫(xiě)腳本的編劇家耕作先生突然消失蹤影，只寫(xiě)了一半的劇本則委托小五郎先生幫忙推理出劇中的真正犯人，調(diào)查了耕作房間的柯南等人發(fā)現(xiàn)了許多古董美術(shù)品竊盜團(tuán)的簡(jiǎn)報(bào)，這一切似乎都有著隱情。失蹤中的耕作先生利用郵件將后續(xù)的劇本傳送過(guò)來(lái)，在劇本中出現(xiàn)了奇怪的臺(tái)詞。

現(xiàn)場(chǎng)的鄰居是前男友（前篇）