小蘭和園子聊著幼稚園時的往事，新一當時所做出的櫻花名牌推理，正是他的第一次推理，而在小蘭不知道的情況下新一一直在背后默默地守護著她。櫻花班班主任江舟論介看小蘭的眼神讓新一非常在意，他認為這個老師是故意想要和小蘭親近，他所作出的解釋看似合理，但新一依舊無法放松警惕，新一的父親工藤優作得知后也展開了調查。

毛利小五郎受久須美工械廠社長的委托，調查工廠零部件被偷的案件，為了不引起職員的警惕，柯南和小蘭也一同隨行假裝參觀。在對職員們暗中調查后，行為怪異的谷崎成為毛利小五郎的懷疑對象，三人計劃在倉庫抓住罪犯的現行，不料卻發現谷崎死在了反鎖的房間里。正當案件一籌莫展時，谷崎生前研究的老鼠機器人引起了柯南的注意。

終于熬到了周一，足球隊員問米小圈怎么沒有去打球，米小圈也很無奈，米爸讓他好好練習畫畫，今后好成為聞名世界的大畫家，隊員樂不可支，稱終于將力量相當的米小圈逐出隊伍，今后便可以自己成肌肉老師心目中的第一名了。聽到隊員這句話，無異于給米小圈一個殺手锏，他憤憤不平但是毫無辦法。接著，米小圈又收到一封來自未來的信箋，上面讓他噴水再看，結果米小圈照做，果真看到上面的字了，上面寫著米小圈將來是個大畫家，并且享譽全世界，讓米小圈抓緊現在的每一分鐘好好學習。信箋背后的署名是未來的米小圈。米小圈才不會那么傻，他拿著信箋跑去找米博文，稱自己知道他的伎倆，知道那封字跡會消失的信箋是他寫的，并且叮囑米博文今后還是不要費力氣了，他還是喜歡踢足球，根本不想成為畫家。米博文愣愣站在那里，臉上帶著一副無辜的表情。米小圈將那封來自未來自己的心給車遲說了，車遲卻覺得這是一個非常好的創意，剛好為他未來的發明指明方向，看到車遲什么都能聯想到未來，米小圈很是無奈。沒過多久，米小圈又接到一封匿名信，對方又稱是未來的米小圈寫的，并且稱米小圈未來真的就是一個畫家，并且為了證明他說的沒粗，還給了米小圈另外三個預言，就是米小圈會吃到一餐大

為了追蹤倉田屋駒吉的下落，柯南等人來到荻市進行調查，卻不慎遭到了神秘人的槍擊，所幸無人受傷。因擔心明日香的安危，毛利小五郎迅速向明日香致電，正當二人通話時，明日香卻遭到了神秘人的綁架。寶田先生告訴眾人犯人疑似是藤木律師，并猜測明日香被綁架的地點在指月公園。而柯南則在明日香掉落的手機中發現了其他線索，只身一人前往目的地搜尋明日香的下落。

小五郎讓柯南和小蘭陪他一起去位于大分的別府溫泉旅行，說到別府溫泉最有名的莫過于地獄巡游之旅，就在小蘭和柯南興致勃勃討論的時候小五郎卻在一旁默不作聲。在柯南和小蘭的逼問下小五郎才說出了實情，這次的旅行目的是尋找仲代電氣社長的女兒麻奈美，柯南根據照片找到了麻奈美所住的旅館，但這僅僅只是開始。