家寶返回上海得到了陳菁華的贊賞。然而他心中所想的卻是早些見到曉藍。家寶來到曉藍家，卻發現曉藍已不知去向，家寶悲痛萬分。 細心的魏家次子家軒和小妹秋玲發現了家寶的心事，開始幫助家寶四下尋找曉藍。在這期間，家軒發現了與曉藍長相酷似的周綺。 陳菁華察覺到了家寶的變化并從家軒那里得知了家寶的心事。陳菁華開導家寶應以事業為重，利用季豪婚禮的機會向前來道賀的社會名流展示啟華企業新掌門人的風采。 萬般無奈下，家寶來到了季豪的婚禮，卻意外地發現季豪的新娘竟是曉藍。悲憤的家寶大鬧婚禮，繼而離去。 原來這一切都是張世保的精心安排，而且他的計劃才剛剛開始…… 由于剛剛支付了武漢方面的善后工作和給季豪買房子這兩筆巨款，偏偏各地的供應商又受到挑撥前來催要貨款，資金一時周轉不開，使得啟華企業面臨了生存的危機。 家寶重新振作起來，幫助母親解決公司面臨的窘境。

梅貽琦對陳部長說了幾句話，終于讓陳部長有所動容。周宏章和康澤匯報，裴遠之是GCD無疑。陳部長打來電話，要求康澤放人。林華珺給幫程嘉樹包扎傷口，在得知他被抓時，林華珺的內心很矛盾，她只能祈禱這樣的事情不要再發生。不過如果換作是她，深思熟慮之后也會這么做。兩人談到深處，情不知所以起，結果被雙喜不小心破壞。經學校討論，文頡被開除學籍，他詰問阿美為什么不說一句話，阿美冷漠地說他早就不再像是學生了。裴遠之決定離開西南聯大，鄭天挺不愿意讓他離開學校，但表示理解。1941年除夕之夜，昆明的天空煙火彌漫，林華珺和方悅容一起做剪紙，程嘉樹和裴遠之做餃子。裴遠之告訴程嘉樹，黨組織會將部分暴露身份的黨員和群社骨干分散到其他地方，雖然程嘉樹不是黨員，但他現在和文頡的關系鬧得很僵，裴遠之擔心文頡會對程嘉樹動手，因而勸他先離開。程嘉樹沒有采納他的意見，主要有兩個方面的原因，一則他認為畢竟是在學校，對方不會太過分；二則他和趙忠堯教授的實驗還在繼續，無法中途離開。隨后，大家一起說了一些新年的愿望，希望未來的道路會更好，一副其樂融融的樣子。方悅容需要繼續留在西南聯大，而裴遠之要離開，他們下一次再見，應該就是在延安，因而

家寶經常到修女院看望周綺，久而久之，他愛上了周綺，并對周綺表達了愛意。但周綺不能淡忘家軒，婉拒了他。 就在兩人散步時，日本秘密派進上海的先遣部隊來到，二人被炸彈炸暈。張世保帶領部下出現，將入侵的日本兵全部殺光，并救走了二人。 由于殺退入侵的日本兵有功，世保被民眾稱為抗日英雄。 家寶在醫院里蘇醒過來，他擔心地詢問守侯在床邊的陳菁華和秋玲，知道不知道周綺的下落。二人告訴他，他是被張世保救回來的，卻不知道周綺的去向。 周綺此時正在張世保的住處，她傷勢尚未痊愈，但她得知世保時黑幫人物，拒絕留下。惱怒的世保交待小豹子將周綺賣到了J院。 家寶擔心周綺的安危，開始四處尋找周綺。 周綺被賣到J院后，堅持不肯接客做J女，老鴇拿她沒有辦法，只得同意讓她做雜工。在做雜工的期間，周綺結識了孤兒小銅鑼。

同學們撤往后山，卻沒想到日軍的飛機這次徑直飛向學校。畢云霄大喊讓同學們快跑，程嘉樹想起儀器還在實驗室，立刻跑了回去，畢云霄和林真跟在他身后。三人迅速把儀器收好，跑進學校的應急防空洞躲避。丁小五的姑父是日本間諜，他混入西南聯大后，特地在實驗室的周圍放了鏡片，方便日軍鎖定實驗室進行轟炸。等轟炸次數減少，三人撤離防空洞，程嘉樹返回宿舍拿林華珺送給自己的洋蔥，但被困在宿舍里。宿舍被轟炸起了火，門被鎖塊扣住，文頡聽到程嘉樹的求救聲，但他竟見死不救。這次轟炸，有許許多多的學生受傷，雙喜詢問畢云霄，得知程嘉樹返回宿舍拿那盆洋蔥。另一個剛從學校跑出來的同學說，學校被炸，宿舍也都被炸爛了。雙喜和畢云霄立刻趕回學校宿舍，在千鈞一刻之際救出了程嘉樹。文頡在走之前，告訴程嘉樹說林華珺在南屏大劇院等他，因而他被救出后，往南屏大劇院的方向跑。林華珺在街上，親眼目睹一對夫妻為了保護孩子，死于日軍的轟炸之下，程嘉樹趕至，護著林華珺和那個孩子趴下。轟炸后，剩下一堆受傷的人在舔舐傷口，承受失去親人的痛苦。梅貽琦從鄭天挺口中得知有少部分學生受傷，書籍損毀千余件，實驗室全部被炸毀。他安排鄭天挺一些事宜后，大藥房的繆蘭英女士帶

所有人都以為程嘉樹死了，林華珺在難過之際，收到了一枚自窗口投擲而入的戒指，她知道程嘉樹如今是安全的。在行動前一晚，郭鐵林告訴華珺新的行動方案。而華珺必須留下，并且需要按照原計劃在規定的地方等候。林華珺表示會全力配合，讓警備司的人相信那輛車上坐的是程嘉樹。一兒一昆明慘案的真相，迅速傳遍全國，重慶、成都、延安、遵義、上海等地集會游行，聲援昆明學生，各界人士也紛紛譴責國民黨反動派的暴行，在全國人民的壓力下，蔣介石讓關麟征自請處分，并將李宗黃調離。聞一多帶領學生們向烈士的靈位鞠躬致敬，他們一起宣誓，告慰四位烈士的在天之靈。程嘉樹在報上看到悼詞，十分感傷，要是他也在昆明，好好地和聯大告別該多好。抗戰結束了，西南聯大即將要北歸，梅貽琦發表講話，抨擊“落后就要挨打”的強盜邏輯，讓同學們用知識，讓母親富強起來，讓中國永遠不受欺凌。梅貽琦代表聯大常委會宣布，從今日起，國立西南聯合大學正式結束。馮友蘭宣讀國立西南聯合大學紀念碑的碑文，將西南聯合大學短暫卻又不平凡的歷史娓娓道來，眾人聽完后紛紛鼓掌。雙喜、阿美、潤青和華珺四人一起在國立西南聯大的門口拍照，這是他們留在西南聯大的最后一天。阿美對未來的規劃是考取