受園子的邀請，柯南、蘭、小五郎到輕井澤游玩。因?yàn)樵谏种忻粤寺罚詻Q定在山里的一軒家借宿。在那里，遇見了白天見到的網(wǎng)球教練明石寬人。但是，夜里，卻發(fā)現(xiàn)了寬人的父親巖夫上吊的尸首。在柯南的提示下，警官也發(fā)現(xiàn)從尸體嘴里留下的不正常血跡。之后眾人還得知了石明三年前妻子去世的事情。而明石身上的疑團(tuán)也越來越多。

和葉與小蘭在廚房找食物的時候，柯南和服部也出現(xiàn)在那里，并且兩人又在椅子下面發(fā)現(xiàn)了奇怪的名字，絞盡腦汁想要破解這些文字含義的柯南與服部兩人卻因?yàn)楹腿~無意中的一句話而茅塞頓開，雖然知道了兇手是誰，但卻找不到?jīng)Q定性的證據(jù)，于是二人設(shè)下圈套讓兇手自投羅網(wǎng)，一切都按計(jì)劃進(jìn)行，兇手果然有所行動，可他卻不知道等待他的是兩名偵探！

平次，葉子終于安全到達(dá)小五郎的事務(wù)所，五人在吃飯的時候說道最近都內(nèi)發(fā)生了連續(xù)發(fā)火事件，現(xiàn)場總會留下紅色的馬的人偶。次日，柯南等人造訪委托他們的諸角宅邸后亮子也以可能是自己多疑了為由放棄了委托。而在柯南他們監(jiān)視的過程中遇到了風(fēng)水師曾我和亮子的沖突。就在柯南眾人回去之后又再次發(fā)生了火災(zāi)而地點(diǎn)正是亮子的住處。

柯南他們少年偵探團(tuán)坐阿笠博士的車去野營。在那里認(rèn)識了4個戶外同好會的大學(xué)生。晚上他們中間的泰美卻不見了。柯南他們?yōu)榱藢ふ姨┟蓝鴣淼椒艧熁ǖ母吲_，但在途中撞飛了落下的欄桿。到達(dá)高臺后仍然不見泰美的蹤影，在回來的路上，卻發(fā)現(xiàn)了倒在路邊的泰美遺體出現(xiàn)在街上。雖然看似事故的現(xiàn)場但在高木警官的提醒下警方最終確定是他殺事件！

柯南、小蘭與小五郎因車子沒油了，得到木山家具社長馬島的款待。社長家的宅院每天會流三次水的組合石庭。在去客廳的途中眾人偶遇馬島與下屬發(fā)生沖突的一面。這天木山家具為了紀(jì)念1號店，聚集了眾多相關(guān)者開宴會。而從設(shè)計(jì)石庭的前社長的兒子、木山智則開始，出席者仿佛都記恨馬島。清晨突然發(fā)現(xiàn)馬島社長死在了石庭的中央！