當(dāng)新出醫(yī)生得知來(lái)取健康檢查結(jié)果的小五郎，就是傳說(shuō)中的大偵探之后，便邀請(qǐng)小五郎，小蘭和柯南留在他家里吃便飯，但在飯前卻突然停電，來(lái)電之后，大家在浴室里發(fā)現(xiàn)新出醫(yī)生的尸體，同時(shí)，在浴缸里還發(fā)現(xiàn)了一把刮胡刀，乍一看像是因?yàn)橛|電而死的意外事件，但在柯南看來(lái)卻是一場(chǎng)有預(yù)謀的殺人案件。

次日，山岳莊內(nèi)發(fā)出小蘭的慘叫，柯南等人趕到后發(fā)現(xiàn)恭子被人刺殺，就在大家推測(cè)出誰(shuí)是兇手時(shí)，河邊晃、潮文造和管理員都不見(jiàn)了蹤影，小五郎認(rèn)為潮文造有危險(xiǎn)便急忙跑入山中，不想?yún)s碰上地震，他們救了河邊晃后返回山岳莊，河邊晃承認(rèn)了自己的罪行，但卻否認(rèn)自己是銀狐，那么銀狐到底是誰(shuí)？潮文造又是出于什么樣的目的委托小五郎？

柯南，小蘭和小五郎一行三人搭乘開(kāi)往北海道的特快列車(chē)北斗星三號(hào)，在通過(guò)隧道的時(shí)候珠寶商人出云被人槍殺，兇手將車(chē)窗射穿跳出車(chē)外逃跑，之后警方又在隧道之中發(fā)現(xiàn)了疑似歹徒的男人，這宗命案的過(guò)程簡(jiǎn)直跟柯南的爸爸工藤優(yōu)作一篇未發(fā)表的推理小說(shuō)一模一樣，期間一個(gè)言行奇怪的女人引起的柯南的注意，在柯南揭穿她的謊言后，她終于暴露了身份。

小五郎曾教過(guò)的學(xué)生崎園惠在自己的娘家碰到了一起車(chē)子被人安裝炸彈而被引爆的案件，在爆炸中喪命的人是小惠的妹妹寬美，她在代替不會(huì)倒車(chē)的姐姐小惠倒車(chē)出庫(kù)的時(shí)候慘遭意外，警方一開(kāi)始懷疑嫌犯是個(gè)叫高橋的人，認(rèn)為這個(gè)人和小惠的先生和夫共同籌劃了交換殺人計(jì)劃，原本企圖殺害小惠，沒(méi)想到卻誤殺了寬美，就在他們俯首認(rèn)罪，事情告一段落的時(shí)候，柯南注意到了小惠。

少年偵探團(tuán)在廢棄大樓為園游會(huì)練習(xí)的時(shí)候，逃逸的嫌犯在佐藤和高木兩位警官的追擊下闖了進(jìn)來(lái)，嫌犯從屋頂逃到隔壁的美術(shù)館，但佐藤警官還是在廁所將他逮捕，但由于操作失誤，她將自己和歹徒都用手銬銬住無(wú)法自由活動(dòng)，嫌犯東田聲稱(chēng)他是無(wú)辜的，逃跑完全是為了參加女兒的婚禮，最后佐藤警官?zèng)Q定讓高木和少年偵探團(tuán)在一定的時(shí)限中找到真兇。