白鳥警官記憶中的少女小林老師在煙火大會(huì)的夜晚目擊了一場謀殺案件，作為證人的她向白鳥警官提供了三條線索即兇手和死者爭執(zhí)的聲音、疑似搬家公司的貨車以及兇手的背影，在警局接受偵訊的期間，小林老師無意中得知白鳥警官曾追求過和自己很像的佐藤警官，這個(gè)消息沉重打擊了小林老師，難道自己只是佐藤警官的替身？抱有這樣想法的她該如何面對(duì)白鳥警官。

這兩人竟然是長野縣警官上原由衣和大和敢助，他們此次前來的目的是讓柯南和小五郎幫忙破解沾滿鮮血的赤壁之謎！于是一行人來到案發(fā)的希望之館，這里曾經(jīng)住著六個(gè)很有才華的年輕人，自從三年前一名女性小葵心臟病發(fā)去世之后，她的丈夫明石周作就獨(dú)自一人留在館內(nèi)生活，可是他卻被人鎖在館內(nèi)的屋中活活餓死，如今能看到的只有他留下的奇特死亡訊息，這時(shí)，大和警官的死對(duì)頭諸伏高明警官也來到館內(nèi)進(jìn)行調(diào)查。

就在兇手企圖用球棒襲擊被騙到音樂室的小林老師時(shí)，他卻反過來被小林老師撂倒，這時(shí)，少年偵探團(tuán)和白鳥警官出現(xiàn)，原來小林老師早已被白鳥警官所保護(hù)而眼前這個(gè)人正是佐藤警官，期間，小林老師想起了以前在書店發(fā)生的事情，誤會(huì)消除的二人重歸于好。麒麟角是鈴木次郎吉在山中寺廟發(fā)現(xiàn)的寶物，而基德又以此為目標(biāo)出了預(yù)告函，次郎吉率領(lǐng)基德無法喬裝的少年偵探團(tuán)以及進(jìn)行直播的工作人員來到寺廟，麒麟像被藏在寺廟的立柱中間，想要拿取它并非易事……

就在萬由美好不容易找到自己的身份的時(shí)候卻突然逃走了，而她遺失的紙條上寫著“要知道真相就一個(gè)人來”的信息！而就在柯南追過來之后發(fā)現(xiàn)險(xiǎn)遭毒手的萬由美。在眾人調(diào)查神社時(shí)得知萬由美之前曾來過這里。晚上萬由美又再次的險(xiǎn)遭綁架，但凡人卻留下了一份借條，借此柯南推斷出了犯人的身份，而所謂的好友的身份也最終暴露出來。

這天作為地區(qū)體驗(yàn)采訪的嘉賓，小蘭和柯南來到了岡山。在參觀美術(shù)館的時(shí)候遇到失去記憶的奇怪女人，而在經(jīng)過檢查后發(fā)現(xiàn)身上還有扭打的痕跡。而趕來小五郎接受了調(diào)查她過去的委托。通過她畫的畫小蘭她們開始尋找她的記憶，而就在這時(shí)柯南發(fā)現(xiàn)她們被跟蹤了。在來到野崎家的大宅之時(shí)出現(xiàn)了認(rèn)識(shí)她的人而她的名字是吉瀨萬由美，找回名字的萬由美卻突然逃走了！