鈴木次郎吉宅邸中的大保險(xiǎn)柜——鐵貍是由幕末的機(jī)關(guān)師三水吉右門衛(wèi)制造的無法攻陷的最強(qiáng)保險(xiǎn)柜。針對(duì)鐵貍，怪盜基德拋出了挑戰(zhàn)書，揚(yáng)言自己將打開那個(gè)擊退了無數(shù)盜賊的堅(jiān)固門扉，然而在鐵貍外，次郎吉還安裝了與重量傳感器聯(lián)動(dòng)的防盜裝置，任誰想要接近保險(xiǎn)柜都極其困難。在預(yù)告作案的當(dāng)天，中森警官率領(lǐng)警隊(duì)進(jìn)行了嚴(yán)密的布防，可是基德的第二封預(yù)告信還是出現(xiàn)在了保險(xiǎn)柜前，難道他已潛入宅邸？

這天小五郎和柯南看到警車駛過，便和目暮警官一同趕往殺人現(xiàn)場(chǎng)。原來是公寓的某屋內(nèi)發(fā)現(xiàn)了小說家齊川村子的尸體。死因是頭部被物品打擊致死。發(fā)現(xiàn)尸體的是迷宮出版社的編輯遠(yuǎn)野舜一和公寓管理員村田啟三。遠(yuǎn)野說齊川之前收到了恐嚇的明信片。而在警方的調(diào)查下柯南最終發(fā)現(xiàn)了犯人的真面目。

死羅神和服部一唱一和，兩人一起揭穿了假新一的身份并且還將當(dāng)年村長(zhǎng)及其妻子遇害一案再次向大家說明，而這個(gè)死羅神自然也就是工藤新一本人。案件結(jié)束后，新一的身體再次發(fā)生變化，幸虧灰原的及時(shí)趕到，新一才保住了秘密不被發(fā)現(xiàn)，在驅(qū)車回家的途中，一輛車很危險(xiǎn)的在馬路上行駛，當(dāng)大家努力將其攔下后卻發(fā)現(xiàn)開車的人已被人勒死。

小五郎，蘭，柯南一行人受到虎田直信的委托，負(fù)責(zé)調(diào)查他的兒子義郎離奇死亡的案件，與此同時(shí)，服部在虎田的死對(duì)頭龍尾家調(diào)查他兒子康司的死亡，與義郎相同，康司的尸體旁也擺放了一只死蜈蚣。當(dāng)晚，和葉和小蘭看到了身著鎧甲的戰(zhàn)敗武士的影子，得知此事后，龍尾家的綾華神大驚失色跑了出去，而發(fā)現(xiàn)她的時(shí)候，她已經(jīng)被吊死在一顆樹上，腳下同樣出現(xiàn)了一只死蜈蚣。

柯南、小蘭和園子一起去醫(yī)院看望國(guó)中同學(xué)的時(shí)候，遇到了拿著照片四處詢問的本堂英祐，照片上的人正是水無憐奈，但英祐卻堅(jiān)持認(rèn)為水無憐奈和姐姐是兩個(gè)人，于是，小蘭打電話給水無憐奈的超級(jí)粉絲庵野進(jìn)行確認(rèn)，沒想到對(duì)方竟然說她打錯(cuò)了，隨后一行人來到庵野家，他的母親正準(zhǔn)備出門取錢，柯南察覺到事有蹊蹺，斷定讓她打錢的那個(gè)人根本就是詐欺犯，在大家的幫助下，詐欺犯被送往了警局，而尋找水無憐奈也進(jìn)入了正題。