懷疑小蘭的高中英語(yǔ)教師朱蒂是黑衣組織的成員而拜訪公寓的服部平次與柯南，遇上朱蒂隔壁房間的主人高井墜樓摔死的案件。確信密室狀態(tài)的臥室從窗戶墜落的高井不是自殺而是他殺的兩人，在臥室調(diào)查中的平次接到和葉從大版打來(lái)的電話而明白犯罪手段的平次加上高井留下的證據(jù)。兩人向目暮警官建議在臥室重現(xiàn)案發(fā)。

發(fā)燒的小哀醒過(guò)來(lái)發(fā)現(xiàn)阿笠博士倒在了電腦之前，正當(dāng)小哀以為教授被黑衣人殺害的時(shí)候發(fā)現(xiàn)只是誤會(huì)。之后柯南，小哀和阿笠博士去拜訪了哀的父親宮野博士的朋友出島。他們認(rèn)為他可能多少知道一點(diǎn)黑暗組織的以及哀父親的行蹤，但是出島也已經(jīng)30多年沒(méi)和宮野博士碰頭了。但是就是最近宮野博士女兒明美曾來(lái)拜訪過(guò)，正當(dāng)柯南，小哀尋找明美留在這里的物品時(shí)出島卻意外死亡！

解決了橫濱中華街的命案之后，小蘭突然倒地不起，在發(fā)高燒的情況下想起過(guò)去碰到的命案。那是與新一去紐約時(shí)發(fā)生的事情，有希子帶他們兩人一起去看話劇，在劇場(chǎng)門(mén)口與明星莎朗匯合后，大家一起去參觀開(kāi)演前的舞臺(tái)陳設(shè)，不想這時(shí)卻發(fā)生了意外，盔甲服裝從天花板上墜落，而其中一名女演員卻無(wú)法躲避，危機(jī)時(shí)刻，小蘭挺身而出。

平次，葉子終于安全到達(dá)小五郎的事務(wù)所，五人在吃飯的時(shí)候說(shuō)道最近都內(nèi)發(fā)生了連續(xù)發(fā)火事件，現(xiàn)場(chǎng)總會(huì)留下紅色的馬的人偶。次日，柯南等人造訪委托他們的諸角宅邸后亮子也以可能是自己多疑了為由放棄了委托。而在柯南他們監(jiān)視的過(guò)程中遇到了風(fēng)水師曾我和亮子的沖突。就在柯南眾人回去之后又再次發(fā)生了火災(zāi)而地點(diǎn)正是亮子的住處。

因?yàn)榇跬皆谡◤椛涎b了竊聽(tīng)器，可以聽(tīng)到他們的一舉一動(dòng)，只要他們一逃走，歹徒就會(huì)馬上引爆炸彈，于是，柯南建議將炸彈拆除，期間，他突然想起了關(guān)于另外一枚炸彈的線索，便和高木警官稍作商量，為正在竊聽(tīng)他們的歹徒演上一出戲，眼看炸彈上的時(shí)間一點(diǎn)點(diǎn)流逝，柯南和高木警官能否瞞過(guò)歹徒安全逃脫？而另一邊，目暮警官在天橋上將爆炸狂逮捕，他是如何得知歹徒的位置，又是根據(jù)什么推斷出另外一枚炸彈的位置呢？