紀曉嵐拿到賬本后隱隱不安，果然有人趁紀曉嵐不備時搶走賬本。乾隆和瑤琴經過生死磨難，已是兩情相悅、不能自已。收到張了了送來的賬目，和珅將假賬目交與盧焯以做郭天貪污的證據，由于瑤琴被救，和珅與盧焯決定改變計劃，同意郭天自盡，對外宣稱其是畏罪自殺。乾隆藥醒，得知自己身份已暴露，干脆帶瑤琴趕往浙江營救郭天。劉全再次用柳哥要挾張了了，讓其做偽供，佯稱和珅給盧焊的假賬目是從紀曉嵐身上搶走的真賬目。瑤琴擊鼓鳴冤，和珅與盧焯見乾隆駕到慌忙升堂。乾隆堂上審訊，和珅與盧焯讓張了了出面，試圖將責任推到紀曉嵐身上而瞞天過海，誰知紀曉嵐拿出真賬本，并聲稱自己早已有所防備，張了了搶走的只是副本。

皇上自號“許仙”來到公堂上，主動作證，“指鹿為馬”和不敢再做“和”，在燕城官員面前狼狽不堪，紀曉嵐揚眉吐氣，乘勝追擊。和遭戲弄，不敢公然發(fā)作，只得指桑罵槐，以泄私憤。為了搞清貪案主犯大通錢莊的薛老板真實身份，二人不免還要再來一次口舌之爭。 劉志婦人多年來忍受相思之苦，如今母子團圓，可謂喜從天降，但也不愿給皇上的前程添麻煩，力勸兒子以國為本，速速返回京城。與此同時，福康安暗送十四王爺一道可以暢通無阻之令牌，謀害之心不死。為促使王爺及早離開，四姑娘加意接受福的感情。 小月女扮男裝，奉紀氏之命，率官兵查封私自囤糧，謀取暴利的不法奸商薛大老板的店鋪，不想薛大老板竟是剛剛與皇上母子相認的柳志夫人，柳志夫人不甘示弱，亦婉轉點出與“許仙”的特殊關系，把難題留給了毫無心理準備的紀曉嵐，和為此暗中得意。 是屈從皇親國戚，枉國家之法，還是剛直不阿，徹底追查元兇，考驗紀曉嵐的不僅有心存負疚庇護生母的皇上，更兼那挑撥離間，趁機誣陷的和，他該何去何從呢？

小月望著一片廢墟、傷心之極。從小春口中得知紀曉嵐等已從暗道逃走，小月破涕為笑。乾隆向百官念叨缺少銀兩以備軍需，紀曉嵐帶領著工匠出現(xiàn)，許諾可以幫乾隆解決難題。人證、物證俱在，齊蘇圖只得低頭認罪。銀妃以死要挾乾隆放過齊家。見乾隆不為所動，銀妃自盡。和珅為了擴大自己在朝中的勢力，暗中支持村夫李二組織邪教，從而謠言惑眾，籠絡人心。一時之間，朝廷內外盡是李二的信徒。工部因大做法事導致衙門失火。和珅答應撥款給工部金尚書以重修工部衙門。御史海升之妻組氏參加了當日作法，海升將失火原因告知了紀曉嵐。和珅同黨吳省蘭將作法用書《佛法心經》奉與皇上，并夸口只要通讀此書，便可百病不侵。和珅不失時機地推薦吳省蘭任左都御史。乾隆以紀曉嵐著成《四庫全書》為由，指派他上任左都御史，并對其寄予厚望。紀曉嵐上任之時，和珅的黨羽劉構傲慢無禮地當眾打坐，向紀曉嵐挑釁。紀曉嵐覺察出邪教實力強大，決定剝繭抽絲，調查到底。

客棧老板以假當真，錯把紀曉嵐當作是戶部尚書、當今皇上的心腹寵臣和，趕緊偷偷稟報燕城統(tǒng)領，卻搞得這幫人十分為難，不知如何接待，才能既表了“忠”心，又不拂逆了“和大人”的本意。 和以穩(wěn)定江山社稷為理由，鼓舌如簧，誘騙十四王爺上鉤，抗旨離開云州赴燕城；四姑娘則借助福康安對自己的單相思，弄清了這是一個陰謀。但她報仇心切，決定將計就計，索性把一片癡情的福康安挾為人質，作為解救王爺?shù)捻来a。 在皇上的授意與允諾下，紀曉嵐把和的官印做了調換，本意是使燕城之行在萬不得已時可以順利進行。不想客棧內再次與那些守城的衙役相遇時，此人竟嚇得面無人色，急忙作揖打恭求饒不已，而燕城和府劉常富率隨從必恭必敬盛宴款待，也讓他對和與此地貪污案關系有了更深懷疑。索性將錯就錯，以和之名，借機盤查一些不易為外人所知的內幕。

紀曉嵐與和聯(lián)手派人護送御醫(yī)呂長安安在回京，這對多年來的冤家對頭即使在相互合作時也不忘反唇相譏，彼此嘲謔。 從呂長安之口，眾人才知四姑娘與十四王爺乃是藥方奇案的罪魁禍首，眼前紙包不住火，陰險毒辣的十四王爺決定丟卒保車，要四姑娘刺殺紀曉嵐后再自殺，以消滅罪跡，眼見自己忠心耿耿追隨的人竟如此冷酷無情，四姑娘徹底絕望，將一劑毒藥一飲而盡。 紫禁城內，皇上召見文武百官，和得意洋洋肆意表功，紀曉嵐巧設圈套，使和、福康安挪用貢品的不義之舉和此后協(xié)助自己調查藥方密案的合作之功一一道出，搞得二人一驚一乍。 十四王爺應召入宮見駕，藥方奇案終于到了真相大白的時候。