最近一連串的事件牽扯出了根的殘黨，佐井在秘密研究所找到了線索。與此同時，早已清楚真正犯人是誰的巳月向博人透漏了消息，但博人卻怎么也不愿相信，因為操縱暗影的竟然是他們的班長堇。在遭到佐井抓捕時堇召喚出了鵺，狂暴的鵺勢必會給村子帶來災難性的打擊，巳月接到的任務是殺掉堇從而停止鵺的活動，面對這種局面博人又會做出怎樣的選擇？

白夜團利用民眾游行包圍了雷門公司，但他們真正的目的則是片助的科學忍具研究所。當大家的注意力全被雷門公司吸引時白夜團搶走了研究所的忍術資料，鹿臺意識到這一點后立即與博人等人趕了過去，他們依靠片助的跟蹤器找到了白夜團，在同伴們的掩護下鹿臺和博人追了上去，他們能阻止白夜團的陰謀嗎？

佐良娜、博人、新希展開決賽混戰，佐良娜和博人聯手對抗新希攻防一體的忍術“黑鐵乃掌”，用雷遁手里劍攻擊新希卻傷不了對手分毫。新希反擊用黑鐵困住佐良娜和博人，佐良娜被黑鐵乃翼重傷倒地，博人為了證明自己使用科學忍具贏得比賽，鳴人親手揭穿兒子的作弊行為。幕后推手片助博士登場，博人意識到自己被人利用，隨后意想不到的人物出現了。

博人在家里照顧生病的小葵時看到了全家的合照，這讓他想起了爸爸任職火影當天的事情，惹怒了小葵的他不光得到了慘痛的教訓，還牽連爸爸整整昏迷了一天。一直忙于工作的鳴人知道女兒生病后立刻趕回了家，他和博人爭執晚餐要吃什么時被雛田趕出了家門，而這對父子也難得在一樂拉面里一起吃了個飯。

三人小隊集合的時候博人遲遲沒有來，巳月在與佐良娜閑聊的時想起了以前的自己。從病床上醒來的巳月完全不記得從前的事情，大蛇丸過來告訴他一個叫羅古的忍者奪走了他的記憶，而自己則是他的至親。雖然巳月心存疑慮但還是選擇相信了大蛇丸，但當他揭開羅古的面具后卻再次陷入了迷茫。