寒假的這天柯南發(fā)燒了休息，而原本約定好的在步美家的紙牌游戲也沒(méi)有辦法參加。就在和步美通電話(huà)時(shí)忽然有個(gè)叫做正南的小男孩說(shuō)有陌生人闖進(jìn)家中敲開(kāi)了步美家的門(mén)，但之后他的父母便過(guò)來(lái)把他帶走了。看似小孩子的惡作劇但柯南卻發(fā)現(xiàn)其實(shí)他們不是真的父母，正南可能真的面臨危險(xiǎn)！于是少年偵探團(tuán)的各位來(lái)到正南的家里一探究竟。

乍看之下發(fā)生在眼前的命案無(wú)疑是自殺事件，但諸多的疑點(diǎn)讓柯南和平次沿著他殺的方向調(diào)查，在詢(xún)問(wèn)過(guò)有嫌疑的三人后柯南和平次有了初步的判斷，但現(xiàn)在還不清楚的是辦案的手法。毛利小五郎的調(diào)侃讓柯南和平次靈機(jī)一動(dòng)，在三名嫌疑人到達(dá)現(xiàn)場(chǎng)后服部利用平板電腦還原了命案的經(jīng)過(guò)。

以幕末的長(zhǎng)崎為舞臺(tái)，有坂本龍馬擔(dān)任的偵探而活躍的推理劇，正在負(fù)責(zé)寫(xiě)腳本的編劇家耕作先生突然消失蹤影，只寫(xiě)了一半的劇本則委托小五郎先生幫忙推理出劇中的真正犯人，調(diào)查了耕作房間的柯南等人發(fā)現(xiàn)了許多古董美術(shù)品竊盜團(tuán)的簡(jiǎn)報(bào)，這一切似乎都有著隱情。失蹤中的耕作先生利用郵件將后續(xù)的劇本傳送過(guò)來(lái)，在劇本中出現(xiàn)了奇怪的臺(tái)詞。

案件解決后大龍警官卻并沒(méi)有要回到大阪的意思，發(fā)現(xiàn)大龍警官的異樣后柯南和平次等人一路尾隨來(lái)到了深山里的洋房，房里的兄弟姐妹們圍繞著遺產(chǎn)繼承話(huà)題明爭(zhēng)暗斗，洋房主人臥室里的棺材存在著諸多的疑點(diǎn)，小蘭和合葉在棺材里看到了駭人的一幕，整個(gè)事件籠罩在吸血鬼那毛骨悚然的氣息之中。

從純夏女士的電話(huà)留言和宅司的表情中柯南看出了這并非是正當(dāng)防衛(wèi)，而是宅司利用自己太太的習(xí)慣策劃的謀殺，他的所作所為會(huì)讓夫妻之間走到盡頭。得知妻子沒(méi)有生命危險(xiǎn)的宅司從安心到負(fù)罪感到恐懼的變化驗(yàn)證的柯南的推理，他與灰原在阻止了宅司自殺后解除了夫妻倆的誤會(huì)，知道真相的宅司陷入了無(wú)盡的悔恨之中。