柯南等人來到方斗寺調查會預知未來的佛像一事，因天色已晚便決定在寺院內留宿。正當眾人享用晚飯時，突然從房內傳出一聲慘叫，原來是正在房中念經的住持被人殺害。毛利小五郎通過柯南在院內找到的一些線索，推斷出了兇手的身份，然而正當兇手跪地坦白自己的罪行時，柯南突然發現案件并沒有結束……

這天，下課了，米小圈看到平時活潑的劉凱竟然坐在自己的座位上折紙，他好奇過去慫恿劉凱一起來玩，劉凱傷心地說他家破產了，爸爸以前總是特別忙，現在賦閑在家好幾天了，并且很多天都沒有吃肉，現在他也只好折紙盒兼職做外快。看到劉凱那么難過，米小圈也忍不住心酸。晚上，米小圈看到家里餐桌上只有一只雞腿，母親在啃生蘿卜，父親在喝蔬菜汁，想到白天劉凱的遭遇，忽然也有種預感，難道他的爸媽也破產了！晚上，米小圈和劉凱通電話，將他家的伙食情況告訴了劉凱，小伙伴斷定他家真的破產了。為了幫助爸媽分擔，第二天上學，米小圈和小朋友商量怎么幫助爸媽度過經濟危機，他的小伙伴建議這世界一本萬利的方法就是用自己的腦子賺錢，他們決定可以用出租漫畫書的方式，這星期三個人忙壞了，終于賺了一百塊錢。有了人生第一桶金，米小圈和鐵頭興奮地憧憬著如果全校同學都來借他們的漫畫書會掙到更多，不久，鐵頭接到一份大單，有人要租全部的漫畫書，米小圈和鐵頭興奮了整整一上午，終于去到約定的時間，對了暗號，沒想到被班長李黎給抓了包。所有漫畫書也被班主任老師扣到了辦公室。晚上，米小圈回到家，看到爸媽依然把最好的食物推到他面前，媽媽繼續啃胡蘿卜，父親僅僅喝了一

根據死者背包中的贓物，秀一判斷該死者可能是一名搶劫犯，同時他發現還有一名嫌疑犯在逃。柯南在秀吉的幫助下帶來了三名有作案嫌疑的游客，經過秀一的推理，真相很快浮出水面，警方也順利抓獲了犯罪嫌疑人。至此，柯南終于回憶起十年前與世良初次相遇的情景，同時他也意識到，世良可能已經知曉自己的真實身份。

通過與世良的接觸，柯南回憶起與世良初次相遇的情形。十年前，秀一從美國回到日本，與家人一起在海灘游玩，恰好偶遇了年幼的新一和小蘭。沉迷偵探游戲的新一引起了秀一的興趣，正當二人交談甚歡時，突然有一輛車從沿海公路上沖破護欄墜入深海。秀一馬上潛入海中實施救援，卻發現駕駛員已當場死亡。根據秀一的推斷，案發前車上應該還有死者的同伴，而死者的身份也是疑點重重……

少年偵探團的理科自由研究作業是拍攝鎮子的全景照片，為此阿笠博士帶他們來到云丸山露營，在山中小屋他們遇到了正在爭吵的四人，而三年前意外去世的元木是他們爭吵的焦點。爭吵過后岳美負氣離開睡在了懸崖底下，半夜的時候榮子等人為三年前因意外去世的元木默哀，正好醒來的柯南見證了這一幕，但在第二天元太卻發現山下的岳美小姐倒在了血泊中。