女主播水無憐奈拜托小五郎調(diào)查一件奇怪的事情，她家的門鈴連續(xù)兩個月無故響起，但卻從未發(fā)現(xiàn)有任何人出現(xiàn)在附近的跡象，并且門口還曾出現(xiàn)過一瓶安眠藥，更離奇的是隔壁空了半年的房子竟然在某天夜里出現(xiàn)了聲響，聽完水無的描述，柯南在她家門口的墻上粘了發(fā)信器，企圖竊聽門外的動靜，之后，又獨自來到隔壁房間調(diào)查并在玻璃門上發(fā)現(xiàn)了“木、美、和”三個字。

根據(jù)死者筆記的記載，怪盜基德也很有可能混在這次尋寶活動中，突然天降大雨，少年偵探隊進(jìn)入了大宅院內(nèi)機(jī)關(guān)重重的房子，元太認(rèn)為寶物一定就在房屋的最高層，便急著前往，不想剛踏上樓梯就踩中了機(jī)關(guān)，所幸被屋子里的一位尋寶獵人所救，之后柯南等人與他一起行動，期間還碰到了另外兩位尋寶獵人，因為元太的粗心，大家掉落屋子的最底層，沒想到這里居然白骨遍地。

小五郎要去參加米花街業(yè)余文藝會演，于是便與柯南，目暮警官和街道主管上島長郎一同前往會場。途中，小五郎等人順路去了目黑美彌開的飯館。大會結(jié)束后，只剩下了有人找的市松留了下來。小五郎，上島等人則去咖啡館“meruhenn”繼續(xù)第二攤。不久后目暮警官卻接到電話報告說市松被刺！最終在柯南的推理下終于揭開了事件的真相。

阿笠博士帶著少年偵探隊來到岡山縣倉敷市展開了一場古代史之旅，他們在這里結(jié)識了因同學(xué)會而重新聚在一起的五名男女，然而就在大家按照撿來的暗號進(jìn)行尋寶時，卻發(fā)現(xiàn)那五人中的一人突然死亡，另外一個則被當(dāng)做重要關(guān)系人接受調(diào)查，根據(jù)少年偵探隊所找到的時光保存罐以及死者留下的死亡訊息，柯南斷定兇手就在剩下的四人中，但要抓住真兇，就必須要找到其他兩個時光保存罐。

柯南、步美等人在阿笠博士的帶領(lǐng)下，來到假面超人的拍攝現(xiàn)場，不巧正好碰上攝制組休息，在這期間不時能聽到陣陣的爭吵聲，劇組工作人員深町堅決反對特效演員力石表演危險動作，可是力石卻倔強(qiáng)的想要證實自己的實力，結(jié)果在表演中發(fā)生了意外，他的車子沖破柵欄從樓頂摔了下來，力石當(dāng)場死亡，當(dāng)所有人都為這場意外感到惋惜時，柯南卻看出了這是巧妙布局的殺人事件。